北京大学硕士医学生物信息学专业目录

211 985 双一流研究生院自主划线

建校时间：1898年
招生简章：共27份简章
院校类型：综合类
所在地区：北京

提交成功

考研考博

招生专业

医学生物信息学戏剧广播电视电影音乐工程管理会计公共管理工商管理情报学图书馆学教育经济与管理应急管理公共政策行政管理企业管理药学护理公共卫生口腔医学运动医学康复医学与理疗学全科医学神经病学超声医学放射影像学临床病理皮肤病与性病学核医学麻醉学耳鼻咽喉科学眼科学妇产科学外科学儿科学内科学护理学口腔医学技术呼吸医学技术康复治疗学眼视光学放射治疗物理学医学检验学医学影像技术学临床药学药理学中西医结合临床中西医结合基础营养与食品卫生学流行病与卫生统计学口腔正畸学口腔修复学口腔颌面外科学牙体牙髓病学口腔基础医学肿瘤学精神病与精神卫生学临床研究方法学重症医学运动医学眼科学妇产科学外科学临床检验诊断学影像医学与核医学儿科学内科学免疫学病理生理学医学细胞生物学医学神经生物学医学生物化学与分子生物学人体生理学放射医学病原生物学人体解剖与组织胚胎学风景园林机械电子信息核技术及应用摄影测量与遥感计算机软件与理论计算机系统结构计算机应用技术信号与信息处理通信与信息系统量子电子学电磁场与微波技术电路与系统物理电子学微电子学与固体电子学材料物理与化学航空航天工程力学系统与控制能源与资源工程环境管理环境健康环境工程环境科学流体力学一般力学与力学基础数据科学生态学科学技术史材料及环境矿物学构造地质学古生物学与地层学地球化学矿物学、岩石学、矿床学空间物理学大气科学大气物理学与大气环境气象学建筑文化与地域景观地理学人文地理学自然地理学城市与区域规划地图学与地理信息系统化学基因组学数据科学基础数学文物与博物馆世界史中国史新闻与传播日语口译日语笔译英语笔译新闻传播学外国语言学及应用语言学亚非语言文学阿拉伯语语言文学西班牙语语言文学印度语言文学日语语言文学德语语言文学法语语言文学俄语语言文学英语语言文学中国民间文学比较文学与世界文学中国现当代文学中国古代文学中国古典文献学汉语言文字学语言学及应用语言学文艺学应用心理汉语国际教育体育医学教育教育技术学高等教育学社会工作法律（法学）法律（非法学）党的建设中国近现代史基本问题研究思想政治教育国外马克思主义研究马克思主义中国化研究马克思主义发展史马克思主义基本原理老年学人口学女性学人类学社会学国际组织与国际公共政策比较政治学国际政治经济学外交学国际关系国际政治中共党史科学社会主义与国际共产主义运动国际经济法商法经济法学诉讼法学民商法学刑法学宪法学与行政法学法律史法学理论审计保险国际商务税务应用统计金融区域经济学西方经济学政治经济学科学技术哲学宗教学美学伦理学逻辑学外国哲学中国哲学马克思主义哲学

招生简章

院系所
考试方式
学习方式
专业
研究方向
拟招人数

(891)基础医学院
统考
全日制
(1001Z8)医学生物信息学
(01)复杂性状的遗传规律解析
专业：（不含推免）

热门问答热门资讯

生物信息学相关出国读研有什么推荐吗

生物信息学专业是一门理科学科，3363363438是利用数学、信息学、统计学和计算机科学的技术研究生物学的学科，研究出各种各样的生物学数据来对后面生物的研究提供方向，很多留学生也纷纷选择留学这门……展开

生物信息学专业是一门理科学科，3363363438是利用数学、信息学、统计学和计算机科学的技术研究生物学的学科，研究出各种各样的生物学数据来对后面生物的研究提供方向，很多留学生也纷纷选择留学这门学科，那么，对于选此专业的学生选校至关重要，下面，带来2017年美国生物信息学专业院校推荐及主要研究方向分析，希望对留学生有所帮助：1、Harvard University 哈佛大学Systems Biology PHD Program哈佛大学在生物信息学方面的研究也一直走在前沿，且由于生物信息学领域的迅速发展应运而生，成立了独立的系，生物信息学科在哈佛大学是叫做Systems Biology。该系成立的时间虽然不长，但经费充足。该项目鼓励拥有计算机、生物、应用数学、应用物理或工程学背景的优秀学生来申请。项目第一年会给学生安排两名导师，分别独立的指导学生，主要是根据学生原本的背景去安排补充学习一些课程。在完成了一年的课程学习之后，就将进入论文阶段，这时会让学生选择其中一名导师作为今后论文指导的导师，并开始独立研究课题并完成论文。2、Columbia University 哥伦比亚大学1)Center for Computational Biology and Bioinformatics PhD Program研究方向涉及到如蛋白质结构、功能预测、蛋白质定位等，具体设置如下：Prediction of protein structure, function and localizationStudy of protein-protein and protein-DNA interactionsGene expression analysis and prediction of regulatory network structureStudy of complex inherited traitsImage analysis and interpretationBiomedical ontology developmentKnowledge extraction from scientific literature and medical reportsEvidence integration2)Biomedical Informatics PhD Program / MA Program属于该生物信息学中偏向医学领域的，其中的PHD program其实是属于(Biomedical Science)生物医学科学下的，主要的研究领域在生物医药、卫生保健等方面，两年的课程学习，后期则全部是独立进行课题研究到最终完成论文。该生物信息学下的MA 学位的program，相当于是硕士学位。就读该专业的学生后面的发展有比较多的选择，例如有些往PHD program发展，有些在医院工作，也有在哥大的医学院内做科研，或者留校做教授等等。学位的攻读上，大致分为两种，一种是应用型的，也就是Applied MA，主要侧重临床，以后实习也会带薪，另一种是研究型的，research MA，侧重科研。这两个方向课程上是有重叠的，但是最后的毕业论文完全是两种类型的，侧重点各自不同。学制方面是research的要稍微长一些。如果并非志在搞纯学术研究的学生，哥大的这个MA 项目是个相当不错的选择。3、New York University 纽约大学纽约大学的生物信息学相关方向分别分布在了计算机学院，生物学院，以及医学院下，相对来说生物学院下所研究的内容与生命科学更相关一些，主要研究基因组学的相关内容，包括基因序列表达、变异等等，纯粹的理论研究偏多一些，且有专门的Center(研究中心);而COB则偏计算机方面，涉及系统建模等等;医学院则毋庸置疑与实际应用方面是紧密结合的。1)Department of Biology：主要研究方向：Genomics & Systems Biology 主要在这个方向下涉及到了生物信息学的相关研究领域Developmental GeneticsMolecular EvolutionMolecular GeneticsMicrobiology & ImmunologyNeurobiologyCancer & Cell BiologyPlant Biology2)Mount Sinai School of MedicineBasic Sciences Departments主要研究方向：Developmental and Regenerative BiologyGene and Cell MedicineGenetics and Genomic SciencesHealth Evidence and PolicyMedical EcationMicrobiologyNeuroscienceOncological SciencesPharmacology and Systems TherapeuticsStructural and Chemical Biology3)Computational Biology (COB)主要研究方向Macromolecular ModelingComputational GenomicsPhysiological ModelingCellular and Biological Imaging综上所述，以上讲的就是关于2017年美国生物信息学专业院校推荐及主要研究方向的相关问题介绍，希望能给各位赴美留学的学子们指点迷津。收起
考清华大学生物信息学专业的研究生要考哪几门课？

考清华生物信息主要有两种选择：一、自动化系的生物信息学专业初试四门：①内101思想政治容理论②201英语一③301数学一④827电路原理复试时专业综合考试内容：信号与系统二、生物系的生物学专业（只……展开

考清华生物信息主要有两种选择：一、自动化系的生物信息学专业初试四门：①内101思想政治容理论②201英语一③301数学一④827电路原理复试时专业综合考试内容：信号与系统二、生物系的生物学专业（只有一个老师是做生物信息的，所以必须提前联系好该导师）初试四门：①101思想政治理论②201英语一③606生物学④844生物化学与分子生物学或 871细胞生物学复试一般情况下没有笔试收起
中科院考研生物信息学的难吗？大概要个什么分数？

楼主复你好，具体开生物信制息学专业的中科院研究所有北京基因组研究所上海生命科学研究院生物物理研究所遗传与发育生物学研究所。北京上海的研究所，如果你本科院校不是很好，难度很大，一般分……展开

楼主复你好，具体开生物信制息学专业的中科院研究所有北京基因组研究所上海生命科学研究院生物物理研究所遗传与发育生物学研究所。北京上海的研究所，如果你本科院校不是很好，难度很大，一般分数线超a类线50 60以上，复试都要刷近一半人，如果你能走推免更好。收起
学习生物信息学专业研究生，一般需要学哪些数学课程？

不能笼统地说学数学，要有针对性的学生物中需要用到的。其实生物生物信息专学也很宽泛，要看你做哪些方属面，要是做群体生物学或者基因预测则需要很多数学的，例如T检验 F检验等，要是做蛋白质结构方……展开

不能笼统地说学数学，要有针对性的学生物中需要用到的。其实生物生物信息专学也很宽泛，要看你做哪些方属面，要是做群体生物学或者基因预测则需要很多数学的，例如T检验 F检验等，要是做蛋白质结构方面的数学很少用。但是基础的微积分线性代数数值方法离散数学概率统计是要会的，再就是数据结构中的一些算法。收起
你好，我是一名生物技术专业的大三学生，想考取生物信息学的研究生，难度大吗？有哪些院校可考取？

1,先解决你的第二复个问题，你上搜制狗，搜索“2011年中国本科院校生物信息学专业排行榜”，你就可以看见全国本专业院校排名了。你就根据自己的条件选了。2，解决你的第一个问题，上你所选的几个或者……展开

1,先解决你的第二复个问题，你上搜制狗，搜索“2011年中国本科院校生物信息学专业排行榜”，你就可以看见全国本专业院校排名了。你就根据自己的条件选了。2，解决你的第一个问题，上你所选的几个或者一个院校研究生招生网看看历年报考人数，录取人数，录取率，你基本可以了解难不难的问题了。如果你觉得以上数据不足以说服你，上你所考院系研究生BBS看看大家对你关注的问题的回答。收起
请问，国内哪些学校招收“生物信息学”硕士研究生？

国内copy有以下学校招收生物信息学硕士研究生华东师大生物信息学专业南开大学 - 生命科学学院 - 生物信息学业中国科学院 - 遗传与发育生物学研究所 - 生物信息学专业武汉病毒研究所生物信息学专业……展开

国内copy有以下学校招收生物信息学硕士研究生华东师大生物信息学专业南开大学 - 生命科学学院 - 生物信息学业中国科学院 - 遗传与发育生物学研究所 - 生物信息学专业武汉病毒研究所生物信息学专业吉林大学 - 计算机科学与技术学院 - 生物信息学专业浙江大学 - 生命科学学院 - 生物信息学专业浙江大学 - 科学技术研究院 - 生物信息学专业四川大学 - 生命科学学院 - 生物信息学专业北京师范大学 - 生命科学学院 - 生物信息学专业复旦大学 - 生命科学学院 - 生物信息学专业西北农林科技大学 - 生命学院 - 生物信息学专业中国科学技术大学 - 生命科学学院 - 生物信息学专业中国科学技术大学 - 微尺度物质科学国家实验室 - 生物信息学专业中国科学技术大学 - 合肥智能机械研究所 - 生物信息学专业中国科学院 - 上海生命科学研究院 - 生物信息学专业中国农业大学 - 生物学院 - 生物信息学东北师范大学中国科学院上海生命科学研究院收起
生物信息学考研院校排名榜

学校排名的话可以去看学科评估排名那个是比较正规的国家排名……展开

学校排名的话可以去看学科评估排名那个是比较正规的国家排名收起
求国内招收“生物信息学”硕士研究生的院校，越全越好，985211及双非本科等

　　(10019)中国农业大学自(11)北京市　　(14430)中国科学院大学(11)北京市　　(91101)军事科学院(11)北京市　　(10157)沈阳农业大学(21)辽宁省　　(101……展开

　　(10019)中国农业大学自(11)北京市　　(14430)中国科学院大学(11)北京市　　(91101)军事科学院(11)北京市　　(10157)沈阳农业大学(21)辽宁省　　(10163)沈阳药科大学(21)辽宁省　　(10246)复旦大学(31)上海市　　(10335)浙江大学(33)浙江省　　(10392)福建医科大学(35)福建省　　(11065)青岛大学(37)山东省　　(10504)华中农业大学(42)湖北省　　(12121)南方医科大学(44)广东省　　(10712)西北农林科技大学(61)陕西省　　(10718)陕西师范大学(61)陕西省收起
中科院考研生物信息学的难吗

具体开生物信息学专业的中科院研究所有北京基因组研究所上海生命科学研究专院生物物理研究所属遗传与发育生物学研究所。北京上海的研究所，如果你本科院校不是很好，难度很大，一般分数线超a类线……展开

具体开生物信息学专业的中科院研究所有北京基因组研究所上海生命科学研究专院生物物理研究所属遗传与发育生物学研究所。北京上海的研究所，如果你本科院校不是很好，难度很大，一般分数线超a类线50 60以上，复试都要刷近一半人，如果你能走推免更好。具体开生物信息学专业的中科院研究所有北京基因组研究所上海生命科学研究院生物物理研究所遗传与发育生物学研究所。北京上海的研究所，如果你本科院校不是很好，难度很大，一般分数线超a类线50 60以上，复试都要刷近一半人，如果你能走推免更好。收起
生物信息学考研需要考哪些课程???请知道的友友帮帮忙~~~~

我是东北农大的我们学校的生物信息学考：①101政治理论②201英语或202俄语或203日语③315化学（农）④414植物生理学与生物化学我在北京。生物信息学的，一般学校硕士毕业，月薪4-5k，不会再多。认真……展开

我是东北农大的我们学校的生物信息学考：①101政治理论②201英语或202俄语或203日语③315化学（农）④414植物生理学与生物化学我在北京。生物信息学的，一般学校硕士毕业，月薪4-5k，不会再多。认真得干四五年回后或许会拿到1w；计算机软答件工程，一般学校本科毕业，月薪4-5k，干五年后会拿到1.5w左右，这都是我周围的人的经历，你自己权衡吧。收起

医学与计算机科学的结合：人工智能可以有效诊断罕见病

波恩大学的研究人员表示，将人工智能、基因和病人数据结合使用，可以提高诊断水平。每年，全世界大约有50万儿童出生时患有罕见的遗传性疾病，而确诊这些疾病将比较困难和费时。因此科学家利用人工智……展开

波恩大学的研究人员表示，将人工智能、基因和病人数据结合使用，可以提高诊断水平。每年，全世界大约有50万儿童出生时患有罕见的遗传性疾病，而确诊这些疾病将比较困难和费时。因此科学家利用人工智能对患有105种不同罕见疾病的679名患者进行了研究，结果表明，人工智能可以更有效、更可靠地诊断罕见疾病，此次的研究结果发表在《医学遗传学》杂志上。医学博士解释，许多患有罕见疾病的病人要经过漫长的试验和磨难才能得到正确的诊断，这会导致了宝贵的时间的损失，如果在早期发现并及时治疗能使患者避免被疾病伤害，而人工智能似乎可以做到这点，智能神经网络会自动将人像照片与遗传和病人数据结合起来后更快以及更准确进行分析。研究团队一起展示了人工智能如何能够在面部分析中做出相对快速和可靠的诊断。研究人员使用了679名患者的数据，他们患有105种不同的疾病，这些疾病都是由单一基因的变化引起的。这些包括，例如，粘多糖病(MPS)，它能导致骨骼变形，学习困难和发育迟缓。马布里综合征也会导致智力残疾。所有这些疾病的共同之处在于，受影响者的面部特征都表现出异常。使用这些软件可以从照片中自动检测出疾病特征，并且结合患者的临床症状和遗传数据，可以高精度地计算出最可能涉及的疾病。目前研究团队与科技公司合作开发出神经网络深度格式塔的程序，其作为人工智能工具进行分析，并且结合大约3万张罕见综合症患者的画像训练了这个计算机程序。研究者表示，结合面部分析，有可能过滤掉决定性的遗传因素，并优先考虑基因，在神经网络中合并数据减少了数据分析时间并提高了诊断率。英国联合大学基因组统计和生物信息学的负责人表示，这对我们来说具有重大的科学意义，也使我们能够在一些尚未解决的案件中找到原因，这项研究是计算机科学和医学的合作成果，也离不开众多科学家的努力。人工智能可以帮助患者得到及时准确的诊断，并且支持医生缩短诊疗时间，这也在一定程度上提高了受影响人群的生活质量。在6月15日至18日，瑞典哥德堡将举行欧洲人类遗传学学会(ESHG)会议，届时科学家将在此次会议中发表他们的研究成果。来源：news-medical收起
这4所大学部分专业有少量调剂名额，还有机会上岸！

后面还有很多学校会发布二次、三次调剂信息，希望大家不要放弃！福建医科大学基础医学院2020考研调剂信息（三）001理学（07）071006神经生物学：4人071009细胞生物学：1人071010生物化学与分子生物学……展开

后面还有很多学校会发布二次、三次调剂信息，希望大家不要放弃！福建医科大学基础医学院2020考研调剂信息（三）001理学（07）071006神经生物学：4人071009细胞生物学：1人071010生物化学与分子生物学：1人07101Z生物信息学：3人医学（10）100101人体解剖学与组织胚胎学：1人100102免疫学：1人100103病原生物学：2人100104病理学与病理生理学：3人105128临床病理学：2人北京林业大学信息学院电子信息（软件工程方向）（非全日制）（专硕），将于06月02日早08：00-06月03日下午18：00华南农业大学经济管理学院：农林经济管理调剂，3人，调剂系统开放2020年6月1日12时—2020年6月2日18时，共30小时。2020北京国家会计学院硕士研究生招生调剂信息（第二轮）会计硕士（非全日制）有意向的考生可于2020年6月2日12:00在研招网调剂系统中报名。收起
2020CHINC通联站论坛：聚焦基于医疗数据的临床科研平台

随着云计算、大数据、物联网、移动互联网、人工智能等信息技术对医疗健康业务的深度融合，医疗健康数据呈现爆发增长、海量集聚的特点，如何有效利用健康医疗数据，服务临床科研成为医疗机构急待解决……展开

随着云计算、大数据、物联网、移动互联网、人工智能等信息技术对医疗健康业务的深度融合，医疗健康数据呈现爆发增长、海量集聚的特点，如何有效利用健康医疗数据，服务临床科研成为医疗机构急待解决的问题。在2020年8月23日下午举办的2020中华医院信息网络大会（CHINC）的通联站论坛上，与会专家将集中讨论与基于临床数据的临床科研平台有关的话题。通讯站论坛由上海市儿童医院院长于广军和复旦大学附属华东医院信息中心主任冯杰共同主持，内容涉及医院数据科研利用、数据平台建设、流行病学与医疗大数据的关系等话题。他山之石，可以攻玉，主办方邀请了法国科研机构，为与会学员介绍法国智慧医疗体系和医疗数据管理情况，为我国医疗行业起到借鉴作用。8月23日下午通联站论坛——基于医疗数据的临床科研平台（紫金厅）主要内容：医院数据赋能科研利用——计虹北京大学第三医院信息管理与大数据中心主任法国的智慧医疗体系和医疗数据管理——雷萍法国法中卫生研究院执行院长整合临床信息与生物信息的智慧医疗平台建设——于广军上海市儿童医院院长流行病学与医疗大数据应用的关系是融通共进——梁会营广东省医疗数据智能化应用工程技术研究中心主任、广州市妇女儿童医疗中心数据中心主任医疗数据开放与患者隐私脱敏处理——郑西川上海交通大学附属第六人民医院信息中心主任部分主持人及授课专家介绍于广军上海市儿童医院院长上海市儿童医院/上海交通大学附属儿童医院院长，研究员，博导。上海交大中国医院发展研究院医疗信息研究所所长，上海医师协会儿科分会副会长、上海妇幼研究会副会长、上海医学会互联网医疗专委会主委、中国医师协会儿科分会常委儿保专委会副主委。上海第四届医务青年管理十杰。2013年卫生系统优秀学科带头人；2014年被批准享受国务院特殊津贴。2015年入选上海市领军人才。2018年上海市优秀学术带头人。目前研究领域为儿童保健和医疗信息化。近年来在儿保方面牵头开展了高危儿多学科合作的干预研究、多动症的医教结合研究项目。在信息化方面，承担了国家863课题《区域医疗大数据的研究与应用示范》。2011年获得上海市科技进步一等奖，中国医院协会科技创新一等奖；2013年获得国家科技进步二等奖。2017年中国医院协会科技创新二等奖。近期著作有《走进移动健康时代》、《儿童雾化治疗指南》、《健康医疗云》和《医疗大数据》。冯杰复旦大学附属华东医院信息中心主任1991年从事医院信息化建设工作至今。目前，担任中国医院协会信息专委会委员，中国医药信息学会上海分会副理事长，中国高等教育学会医学教育专业委员会医学现代教育技术学组委员，中国健康促进基金会健康大数据与智能医学发展专项基金管理委员会委员，中国医学装备协会数字医疗技术分会委员，中国心胸血管麻醉学会信息技术专委会委员，上海医院协会信息专委会委员，复旦大学附属医院信息管理分委会委员,上海市医保支付改革咨询专家。计虹北京大学第三医院信息管理与大数据中心主任硕士，研究员。北京大学第三医院信息管理与大数据中心主任。从事医院信息化工作20年。任中国卫生信息与健康医疗大数据学会卫生信息标准委员会副主任委员；中国医院协会信息管理专业委员会常委；中国研究型医院学会医疗信息化分会副会长等职；参与撰写《医院信息系统功能设计指导》、《健康医疗大数据》、《现代医院信息化建设策略与实践》等8部行业论著。曾荣获全国医院信息化杰出创新力人物、年度优秀CIO等荣誉。承担国家自然科学基金、863课题、国家卫健委、首发基金等多项课题研究。发表学术论文50余篇。率领团队首批获得《国家医疗健康信息医院互联互通标准化成熟度测评》五级乙等和新标准下《电子病历功能应用水平分级评价》六级级别。雷萍法国法中卫生研究院执行院长博士，研究员，硕士生导师，欧中公共卫生学院执行院长，法国法中卫生研究院执行院长，法国巴黎政治大学卫生政策研究中心中国项目负责人，法国英赛克高等商学院管理学终生教师。2007年开始致力于法中卫生交流。2009年获得法国格勒诺布尔大学管理科学与工程专业博士学位。于2010年加入法国英赛克高等商学院从事教学科研以及中法教育合作工作。2016年担任法国法中卫生研究院（ Institut Franco-Chinois pour la Santé IFCS）并执行院长职务。2018年获得法国巴黎政治大学卫生政策管理专业EHPA学位并成为巴黎政治大学卫生政策研究中心中国项目负责人。梁会营广东省医疗数据智能化应用工程技术研究中心主任广州市妇女儿童医疗中心数据中心主任卫生统计学硕士，生物信息学博士，临床流行病学博士后。主要从事健康医疗数据库建设和数据挖掘方法学研究，主持国家自然科学基金、省市科研项目5项。发表论文60余篇，其中第一（通讯）作者身份发表SCI论文20篇，单篇论文最高引用94次。申请发明专利5项，软件著作权11项。郑西川上海交通大学附属第六人民医院信息中心主任硕士，上海交通大学生命学院生物医学工程专业硕士研究生导师，中国医院协会信息管理专业委员会（CHIMA）委员，中国生物医药技术协会医药信息分会常务理事，中国卫生信息学会卫生信息安全与新技术应用专业委员会常委，中国生物医学工程学会数字医疗与医疗信息化分会常委，上海医学会互联网医疗专委会委员兼秘书。近年来，承担科技部国家重点研发计划项目、科技部863课题以及上海市信息化发展项目多项，发表专业论文80余篇。关注领域：医疗信息标准、临床电子病历以及医疗大数据应用。*大会议程及内容设置以现场公布为准2020中华医院信息网络大会（CHINC）——看点预告2020CHINC会前透视——开幕式及主论坛精彩纷呈2020CHINC大会之精品培训课：聚焦医疗网络安全2020CHINC大会之精品培训课：医院CIO职业发展与业务管理专场2020CHINC大会之精品培训课：医疗信息化建设标准解读2020CHINC大会之新学科论坛：研究型医院信息化建设与实践2020CHINC会前预览——看看“新技术”培训课有哪些亮点？2020CHINC预告：新管理论坛内容聚焦DRG2020CHINC大会之精品培训课：医疗数据应用与治理专场简介2020CHINC大会之新数据论坛：医疗设备数据采集与应用戳这里关于召开2020中华医院信息网络大会（CHINC）的第三轮通知“全国医疗信息化防疫抗疫优秀案例评选”结果揭晓“2019年度全国医院信息化杰出领导力和创新力人物”评选结果揭晓“2020中华医院信息网络大会”征文活动优秀论文评选结果揭晓新媒体部： 010-81138718；81138717 传播数字医学领域发展最新动态，关注医疗卫生信息化相关资讯。收起
人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南

人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南A guide to human microbiome research: study design, sample collection, and bioinformatics analysisChinese Medical Journal [IF: 1.585]DOI……展开

人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南A guide to human microbiome research: study design, sample collection, and bioinformatics analysisChinese Medical Journal [IF: 1.585]DOI: https://doi.org/10.1097/CM9.0000000000000871Review: 2020-6-26钱旭波1, 陈同2, 徐益萍1, 陈雷3, 孙馥香4, 卢美萍1, 刘永鑫5,6浙江大学医学院附属儿童医院风湿、免疫和变态反应科中国中医科学院中药资源中心首都医科大学附属复兴医院易汉博基因科技（北京）有限公司中国科学院遗传与发育生物学研究所中国科学院大学，生物互作卓越创新中心钱旭波和陈同为共同第一作者通讯作者：卢美萍，浙江大学医学院附属儿童医院风湿、免疫和变态反应科，中国浙江杭州竹竿巷57号，邮编：310003，邮箱：meipinglu@zju.e.cn摘要这篇综述的目的是为医学研究人员，特别是那些没有生物信息学背景的研究者提供简单易懂的微生物组学知识，包括研究中常用的概念、技术和分析方法等。首先，我们介绍了基本概念，例如微生物群（microbiota）、微生物组（microbiome）和宏基因组（metagenome）等。然后，我们讨论了研究设计方案、样本量计算方法以及提高研究可靠性的方法。我们特别强调了阳性和阴性对照的重要性。接下来，我们讨论了微生物组研究中常用的统计分析方法，重点关注多重比较的问题以及组间β多样性分析的方法。最后，我们介绍了生物信息学分析的具体流程。总之，严谨的研究设计是获得有意义结果的关键步骤，而适当的统计方法对于准确解释微生物组数据很重要。通过阅读这篇文章，研究者能获得研究设计、样本采集和生物信息分析等全方位的微生物组学知识。关键词：微生物组、研究设计、统计分析、样本量、生物信息分析、分析流程1. 前言随着测序技术和数据分析方法的发展，近几年医学微生物组研究领域出现了一些令人瞩目的成果[1-3]，比如微生物组与代谢性疾病[4-6]、消化系统疾病[7-10]和心血管系统疾病[11]之间的关系日益明确。这些发展和发现增加了医生在微生物组研究方面的兴趣，进而也涌现出了大量有价值的论文[12]。另外，随着QIIME 2[13]和多组学方法[1, 9]等先进技术和分析流程的出现，微生物组分析方法也不断进步。然而，理解和掌握这些技术和分析流程并非易事，特别对于医生来说更是如此。本文的目的是为研究者，特别是那些没有生物信息学背景的医生提供易懂的微生物组学知识，这些知识包括详细的微生物组学基本概念、科研设计方法、样本采集和保存方法、统计分析方法以及生物信息分析方法。我们希望医生们通过阅读此文能够快速掌握以上知识和方法，进而有效地挖掘数据背后的生物学意义。2. 基本概念2.1 Microbiota、Microbiome等术语Microbiota(微生物群/微生物组)是指定植在人体特定部位的微生物，包括细菌、古菌、病毒、真菌和原生动物[14, 15]。在医学研究中，如果测序技术采用的是16S rRNA基因（又称为rDNA），则microbiota是指细菌和古菌。Microbiome是指整个微生境，包括微生物、基因组和周围环境[14, 15]。不过，microbiota和microbiome有时存在混用情况。我们建议，如果你的研究仅涉及微生物本身，则应该使用microbiota，否则应该使用microbiome（图1）。例如，如果研究者想探索肠道短链脂肪酸与微生物的关系，使用microbiome更合适。宏基因组（metagenome）是指微生物基因组的集合[14]，一般用鸟枪法宏基因组测序获得，宏基因组学则是研究宏基因组的学科[12, 14]。病毒组（virome）指人体内或表面的病毒集合，包括内源性逆转录病毒、真核生物病毒和噬菌体[16]。研究病毒组的学科就是病毒组学。作者注：Microbiota国内有些学者翻译为“微生物群”，microbiome翻译为“微生物组”。不过中文文献用“微生物组”或“××菌群”即可，多数情况下不需要区分是microbiota或microbiome。图1：微生物组、微生物群、宏基因组和16S rDNA的概念。（A）微生物组（microbiome）的概念不仅涵盖微生物，而且涵盖周围的环境条件。微生物群（microbiota）仅指微生物本身。（B）宏基因组是指微生物的所有基因组，而16S rDNA仅涵盖基因组的一部分。（C）α多样性衡量样本中的多样性，而β多样性比较样本之间的物种差异。2.2 细菌层级分类细菌分类最常用的层级为门、纲、目、科、属、种、株。例如，临床上十分常见的大肠埃希菌的层级分类见表1。表 1: 大肠埃希菌细菌层级分类2.3 操作分类单元和扩增子序列变异操作分类单元（operational taxonomic units，OTUs）的构建对于标记基因（扩增子）数据分析非常重要[17]。OTU是指一组高度相似的序列，通常将具有97%相似性的一组序列归为一个OTU[18, 19]。不过，这种OTU的方法有显著的缺点，它人为地设置一个相似性阈值，漏掉了细微的和真正的生物学序列差异[20]。最近开发的扩增子序列变异（amplicon sequence variants, ASVs）方法可以解决这些问题，它使用序列变异信息将序列数据解析为准确的序列特征。ASV具有单核苷酸分辨率，并且具有比OTU相似或更好的敏感性和特异性[20]。注意，OTU或ASV不等于物种，一个OTU / ASV可能包括多个物种，反之亦然[21]。2.4 α-多样性α-多样性是指样本内的多样性，常见的样本有粪便，唾液或支气管肺泡灌洗液等[15]。医学研究中经常使用3种α多样性指数：Chao 1指数、香农指数和辛普森指数。Chao 1指数主要反映物种数量（richness），它计算时考虑以下三个因素：物种数量、单条序列数量和双条序列数量[22]。这意味着它不能反映微生物组的丰度（abundance）。香农指数结合了丰度和均匀度信息[23]，它赋予稀有物种更多的权重[22]，这意味着当稀有物种的数量增加时，它的值会更大。香农指数的值通常不超过5.0；它的值越高，α多样性就越丰富[22]。辛普森指数也整合了丰度和均匀度，不过与香农指数比较，计算时它对常见物种有更大权重。它的值介于0-1之间，这个值越大，α多样性越丰富[22]。在以上指数中，richness是指一个样本中物种的数量[17, 24]，而abundance（丰度）指物种的原始序列读数[24]。如果原始序列读数被转换成百分比后，它就称为相对丰度。2.5 β-多样性β-多样性是指样本或组间的微生物组差异，通常用于了解两组微生物组组成的差异是否显著。在这里，我们关注两个常用的β多样性指数：Bray-Curtis相异性和UniFrac距离。Bray-Curtis相异性是一种用于量化两个样本或组间的物种组成差异的指标，其值的范围是0到1，其中0表示两个样本或组间具有相同物种，而1则表示它们不共享任何物种[25]。此外，它在计算时给予常见物种更大的权重[23]。请注意，Bray-Curtis相异性不是真正的距离度量指标，因此用“Bray-Curtis相异性”的叫法比“Bray-Curtis距离”更恰当[22]。UniFrac距离可以不加权，也可以加权，它基于系统发育距离估算微生物组样本或组间的差异[26]。未加权的UniFrac距离只考虑了物种是否存在，它对于检测稀有物种的数量变化很敏感，但是在计算中忽略了丰度信息[27]。加权UniFrac距离计算时纳入了丰度信息[28]，并减少了稀有物种的权重[29]。2.6 排序排序用于探索数据结构，由降维后的正交轴图形表示。排序图是可视化β多样性的有效方法。排序可以分为2大类：非约束排序和约束排序[30-32]。如果图形上的点不受环境因素（样本元数据）的约束，这种排序叫做非约束排序，否则叫约束排序[32]。常用的非约束标准包括主成分分析（principal component analysis, PCA）、对应分析（correspondence analysis, CA）、主坐标分析（principal coordinate analysis, PCoA）和非度量多维标度（non-metric multidimensional scaling, NMDS）[30, 32]。常用的约束排序有冗余分析（rendancy analysis, RDA）和典范对应分析（canonical correspondence analysis, CCA）[31, 32]。微生物组信息是高维数据。PCA通过将数据以几何方式投影到较少的维度上来简化复杂性，它在计算中使用欧几里得（Euclidean）距离[30]。通常情况下它并不适用于物种丰度数据的分析，因为PCA分析的数据必须是线性的[30]。但是如果物种数据经过Hellinger转换，则PCA可以用于物种数据分析[30]。相反，CA适合于物种丰度数据分析，而且无需预先转换数据。在CA分析中，所有样本均使用Pearson卡方距离进行排序[30]。但是请注意，稀有物种可能会对CA分析产生过大影响[33]。如果研究人员希望基于相异性指标来对样本或特征进行排序，那么PCoA是一个不错的选择。在微生物组研究中，PCoA分析最常使用Bray-Curtis相异性和UniFrac距离。NMDS用于表示排序图中样本的相对位置。与PCoA相似，NMDS分析可以使用任何距离或相异矩阵。参考文献[30]详细介绍了PCoA和NMDS之间的差异，在大多数情况下PCoA比较常用。RDA是一种结合了PCA和回归的约束排序，它的响应矩阵是微生物组数据，解释矩阵是临床指标（样本元数据）。RDA对于显示微生物组数据是否受临床指标影响很有用。但是请注意，由于PCA计算过程要求响应矩阵的数据结构必须是线性的，因此可能需要对数据进行预转换。最后，CCA其实就是CA的约束版本，它具有CA的基本特性和缺点[31]。3. 研究设计3.1 研究设计方案严谨的研究设计对于获得准确而有意义的结果很重要。医学微生物组研究中最常使用的研究方法包括横断面研究、病例对照研究、纵向研究和随机对照试验（randomized controlled trial, RCT）。前3种是不应用干预因素的观察性研究，而最后一个是典型的实验性研究。横断面研究分为描述性横断面研究和分析性横断面研究[34]。前者仅是描述性的，主要用于调查一个或多个人群中的微生物组成，而后者则用于探讨微生物组与健康结果之间的关联。但是，微生物组与健康结果之间的关联可能源于混杂因素，例如性别[35]、年龄[36]、体重指数（body mass index, BMI）[37]、饮食[5, 38]、季节[39]和药物治疗[40, 41]。此外，横断面研究时，微生物组和结果是同时测量的，因此很难确定它们之间的因果关系。通常，横断面研究仅用于探索微生物组的基本特征，并且可以作为后续研究的初步实验。在大多数情况下，微生物组被视为暴露（exposure），疾病被视为结局（outcome）。在这些假设下，传统的病例对照研究很少用于微生物组研究，因为以前的暴露（微生物组）信息很难获得。但是，如果暴露和结局对调，则可以使用病例对照研究设计方案。同样，在上述假设下进行前瞻性队列研究也很困难，因为很难知道哪些微生物是潜在的暴露。而且，定义可用作暴露或非暴露因素的特定微生物组并非易事，因此难以将研究对象确定为暴露或非暴露个体。在实践中，有或没有疾病的个体通常归入研究组或对照组，然后在不同时间点前瞻性地收集含有微生物组的样本[17]。也就是说，前瞻性队列研究中的研究对象通常根据临床结局而不是特定的微生物组模式进行分组。RCT或其他实验研究的目的是评估干预措施的有效性。干预措施可以是药物或微生物组。例如，粪菌移植研究中的干预措施是微生物群[42, 43]。值得注意的是，对照组的选择应恰当。以上这些研究设计中应注意匹配混杂因素，这部分内容将在下面讨论。有时对照的选择很困难，尤其是在临床研究中干预措施是微生物群本身的情况下。在这种情况下，如果其他研究设计不合适，那么进行有对照组的前后自身对照试验（controlled before-after trial）或历史对照试验将是一个不错的选择[44]。3.2 定义纳入和排除标准定义确切的纳入标准和排除标准可以使组间更好地匹配，并且有利于控制混淆因素，比如年龄[36, 45]、性别[35]、BMI[46]、饮食[47]、季节因素[39]、药物治疗[40, 41]、种族[48]、地理区域[45]和共存疾病等[7]。年龄可显著影响微生物组，对于那些小于16岁的人更是如此[36, 45]。因此，对于涉及儿童的研究，年龄必须很好地匹配。饮食是另一个对微生物组改变有影响的因素，所以也要进行匹配[47]。为了增加组间的可比性，地理区域因素在研究设计时也需要考虑在内[45]。由于药物治疗对于微生物组有显著影响，所以入组前数月内接受过药物治疗的患者应该排除在外[41, 49]，这里讲的数月通常指入组前3~6个月[49]。3.3 微生物组研究的样本量和检验效能计算在进行研究设计时估计样本量大小非常重要。适当的样本量可使微生物组研究识别出组间的差异，并节省资源和时间。但是，样本量和检验效能计算对于研究者来说仍然是一个挑战[50]。微生物组研究中最常用的样本量和效能计算方法可以用t检验、方差分析、χ2检验和Dirichlet多项式模型[51]。以t检验为例，分3个步骤确定样本大小和效能计算。首先，通过初步实验获得少量扩增子数据。其次，使用R包vegan计算出每个样品的香农指数[52]。最后一步是使用R软件包pwr中的power.t.test()函数计算样本量和效能。当研究者仅关注两组之间物种多样性的差异时，可使用t检验计算样本量和效能。在参考文献[51]中有样本量和效能计算的详细介绍。3.4 阴性和阳性对照的重要性微生物组研究的结果可能会受到多种因素的影响，例如DNA提取试剂盒、采样方法、污染和测序方法等[53]，不过可以通过使用阴性和阳性对照来减少这些影响。不幸的是，以前的研究中只有30％报告使用了阴性对照，只有10％报告使用了阳性对照[53]。使用对照对于准确认识微生物组非常重要，尤其是当样本的微生物含量较低时。以前的研究发现，过去被认为是无菌的标本（例如胎盘和关节液）可能会被微生物定植[54]。但是，这些阳性的结果可能是由其他因素导致的，例如污染。有趣的是，这些低生物含量标本在采用阴性和／或阳性对照后已被证明是无菌的[55]。因此，我们建议当样本为低生物含量样本（例如血液、羊水、脑脊液、关节液和胎盘等）时，应考虑使用阴性和阳性对照。值得注意的是，阴性对照和阳性对照在病毒学研究中也很重要，因为病毒和细菌通常是同时进行检测的[16]。此外，R包decontam可用于鉴定和去除扩增子和宏基因组学数据中的污染物序列[56]。3.5 测序方法的选择微生物组研究中使用的测序方法包括扩增子测序、宏基因组测序和宏转录组测序。扩增子测序包括适用于细菌和古菌的16S rDNA测序以及适用于真菌的内部转录间隔区（internal transcribed spacer, ITS）测序。每种测序方法的优缺点在这两篇参考文献中有详细讨论[17, 57]。简而言之，扩增子测序很便宜，可应用于受宿主DNA污染的低生物含量标本，但一般仅能注释到“属”层级，并且易受某些固有偏倚来源的影响，例如PCR循环数[58]。宏基因组测序方法对样品中存在的所有DNA进行测序，包括细菌、病毒、真核生物和宿主的DNA。它不仅将其分类学分辨率扩展到“种”或“株”的水平，而且还提供了潜在功能信息[17]。但是，扩增子和宏基因组测序方法都无法区分死微生物或活微生物[17]。转录组测序仅产生群落的活跃功能信息。鉴于这些测序方法的优缺点不同，建议将多种测序方法整合在一起以优化研究设计。简而言之，测序方法的选择主要取决于实验成本和样本质量。扩增子测序通常用于获得微生物群落的概况[59]，并且通常适用于大规模研究[6, 60]。如果您有足够的项目资金，并且想要获得菌株水平的分辨率和潜在功能，甚至想要恢复整个基因组，宏基因组测序是一种首选方法[61-65]。3.6 提高研究可靠性的方法简单的横断面研究在微生物组研究中的意义有限。在本小节中我们讨论了提高研究可靠性的方法。首先，首选纵向研究或RCT研究，而不是横断面研究或病例对照研究[17, 66]。其次，应计算样本量[51]。第三，混淆因素应匹配，元数据（即各种临床指标等信息）应仔细收集。第四，应详细定义纳入和排除标准。例如，幼年特发性关节炎有几种亚型，每种亚型可能代表不同的疾病[67]。研究者应确定患者组中是否包括所有亚型。第五，最好考虑使用阴性和/或阳性对照[68]。第六，整合其他组学方法，例如代谢组学、转录组学和蛋白质组学，这对于全面了解微生物群落的结构和功能至关重要[17]。因此，应考虑获取微生物群落代谢物概况和／或其他多组学数据。目前，仅探索微生物群落结构的研究不被视为论证效率强的研究设计[17]。最后，建议在动物模型中验证从临床试验获得的初步结果。表2列出了设计临床微生物组研究需要考虑的因素，图2展示了典型的工作流程。实验研究需要考虑的因素见参考文献[49]。表 2: 临床微生物组研究设计需要考虑的要素核对表RCT：随机对照试验4. 样本类型、保存和储藏4.1 样本类型人类微生物组研究的样本类型包括粪便、结肠灌洗液和腔内刷等（表2）。样本类型的选择取决于感兴趣的研究假设。例如，粪便样本易于收集，可用于大规模和纵向研究。另一方面，活检样本对于探索微生物群与宿主之间的相互作用更有用[69]。注意，在一项研究中应该固定采样位置，因为人体的不同部位定植着不同的微生物群[70, 71]。图2：人类微生物组研究的典型流程。4.2 保存和储藏样品保存和储藏的方法应适合实验方法和样品类型。最通用的方法是直接冷冻样品，它可用于各种测序和实验方法，例如扩增子、宏基因组、转录组测序和代谢组学测定。建议将样品收集后15分钟内保存在-20℃下[72, 73]，然后在收集24小时内用干冰转移到-80℃冰箱中储藏。不过样本通常是在家里而不是在医院收集的，在这种情况下可以使用保存液。保存液中保存的样本可以在环境温度下保存一周以上[74]。请注意，样品的保存和储藏方法应一致，以最大程度地减少潜在的混淆因素干扰。5. 微生物组研究中的统计分析方法医学研究者通常熟悉单变量统计方法，例如t检验、方差分析、χ2检验和秩和检验。因此，我们在这里仅讨论与多重比较和其他多元统计方法有关的问题。我们首先讨论多重比较会遇到的问题及其解决方案，包括P值调整和使用错误发现率（FDR）。然后，我们讨论其他多元统计方法，例如置换多元方差分析（permutational multivariate analysis of variance, PERMANOVA）和Mantel检验。5.1 多重比较的问题及解决方法由于微生物组数据是高维的，因此多重比较经常在微生物组研究中使用。例如，特征表（feature table）具有成百上千个OTU或ASV，并且每个OTU或ASV都可以进行多次比较。医学研究者经常遇到的另一个例子可能更容易理解。假设一项研究分为3组，例如A组、B组和C组，而研究者想比较这3组之间的差异。在这种情况下就应调整P值，因为每个组都进行了2次比较，即A组与B组，A组与C组，B组与C组。如果有任何组或变量需要进行多次比较则必须进行P值调整，以便减少假阳性率[75]。调整P值的经典方法是控制family-wise错误率，即Ⅰ类错误或α水平。Bonferroni是校正α水平最常用的方法。校正P值的计算非常容易：单个检验的α值除以检验次数。因此，对于上述具有3个检验次数的例子，调整后的P值为0.05 / 3 = 0.017，即只有P <0.017的检验结果才被认为是有意义的[75]。请注意，Bonferroni校正仅适用于多重比较次数较少的假设检验，否则会导致较高的假阴性率（图3）[75]。解决多重比较问题的另一种方法是控制错误发现率（false discovery rate, FDR），它是I类错误或假阳性的数量与所有被拒绝的无效假设的预期比例。例如，如果100个阳性假设检验结果中有5个是错误发现，则FDR为5％。在微生物组研究中，通常使用“Benjamini-Hochberg（BH）校正的P值”而不是原始P值。校正后的P = 原始P * m/i，其中m是检验次数，i是每个P值从小到大排序的序号[75]。如果校正后的P值小于你选择的所选FDR，则认为该检验是有统计学意义的。与Bonferroni方法相比，BH方法不那么保守（即校正强度不是很大），BH法通常用于微生物组特征的多重比较。Bonferroni和BH是最常用的P值校正方法[76]，这两种P值校正方法的校正强度见图3所示。图3：不同P值校正方法的校正强度该图显示，Benjamini-Hochberg校正强度小于Bonferroni。随着原始P值的增加，Bonferroni校正法生成的校正后P值快速接近1.0。5.2 PERMANOVA检验有几种统计方法或模型可以用于组间β多样性比较，比如PERMANOVA、Mantel检验、相似性分析（ANOSIM）和多响应置换程序（multi-response permutation proceres, MRPP）。PERMANOVA最常用，并且被认为是以上检验方法中检验效能最大的一种[77]，它可通过R包vegan中的函数adonis()实现[52]。vegan包可计算4种常用相异性或距离度量：Bray-Curtis相异性、Jaccard距离以及加权和未加权UniFrac距离[29]。如果PERMANOVA检验的P值小于0.05，则表明不同组间的β多样性差异具有统计学意义；该检验的另一个输出结果是R2，它表示总方差可以用分组因素来解释的比例[29]。5.3 Mantel检验Mantel检验通常用于分析元数据矩阵和微生物组矩阵之间的关联[77]，它可使用R包vegan中的mantel()函数实现[52, 77]。该检验的输出至少2个主要统计量：P值和r。与其他类型的相关系数类似，r的值范围是-1 ~ +1[29]。例如，假设研究人员想知道元数据种的分组因素（例如吸烟状态）是否对肠道微生物组的组成产生影响。如果P＜0.05并且r＞0，这表明吸烟组和不吸烟组之间肠道微生物组的组成不同，元数据矩阵和微生物组矩阵呈正相关。6. 生物信息分析6.1 扩增子数据分析：从原始数据到物种分类表有几种流行的软件或分析流程（pipeline）可用于扩增子数据分析，例如QIIME 2[13]、USEARCH[78]、VSEARCH[79]和mothur[80]。前两者具有许多优点，并已被许多研究者使用和推荐。每种软件或分析流程的优缺点已在我们先前的论文中详细描述[81]遗传：微生物组数据分析方法与应用和 Protein Cell：扩增子和宏基因组数据分析实用指南。扩增子分析的主要步骤见图4A。我们通常从fastq格式的原始双端Illumina数据开始，最终输出是一个特征表，也称为OTU表或ASV表。第一步是从原始数据中恢复纯净的扩增子序列，因为原始数据包括人造序列产物（artifact），例如引物和标签（barcode）。它包括3个主要过程：合并双端序列，通过标签拆分序列和去除引物。由于原始数据没有统一的标准格式，因此我们需要设计适合上述过程的分析流程。另外，我们也可以使用基因测序公司提供的纯净扩增子数据。图4B显示了用于恢复纯净扩增子序列的典型分析流程。第二步是滤除低质量序列，以便减少背景“噪音”。第三步是识别非冗余序列并且计数。高质量序列仍然有许多人造序列产物，例如错误序列和嵌合体。非冗余序列的计数是找出可靠序列的关键信息。第四步是选择代表性序列（特征）。此步骤基于唯一序列，并通过将序列聚类成OTU或降噪生成ASV来实现[18, 82]。此步骤还包括de novo检测和去除嵌合体。第五步是有参嵌合体检测，这是可选项[83]。通过将序列比对到数据库中，例如rRNA数据库SILVA[84]，可以进一步过滤特征序列。应当指出的是，该步骤可以降低假阳性率但易于导致假阴性结果。最后，通过将纯净的扩增子数据与特征序列进行比较来生成特征表（图4A）。然后使用基于RDP[85]、SILVA或Greengenes[86]数据库的分类器实现特征序列的物种分类。此外，基于16S rRNA基因谱，使用PICRUSt[87, 88]、FAPROTAX[87, 89]和BugBase[90]等工具可实现功能预测。6.2 宏基因组分析：从原始数据到物种和功能分类表扩增子测序仅能获得微生物组部分的分类学信息，而且PCR过程很容易产生偏倚和嵌合体[83]。鸟枪宏基因组测序比扩增子测序提供更详细的基因组信息和更高的分类学分辨率[66]。与扩增子方法相比，宏基因组学分析更为复杂，但是它提供了更准确的物种分类、多维度的功能信息，甚至是末培养微生物的基因组草图。宏基因组分析流程如图4C所示。第一步是预处理原始序列数据。原始数据包含低质量的污染序列以及与宿主相关序列。我们可以使用FastQC软件（http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/ projects/fastqc/）进行数据质量检查，然后使用KneadData流程进行质量控制[91]并去除宿主DNA[92]。有关更多KneadData的信息，请访问 http://huttenhower.sph.harvard. e/kneaddata 。第二步是使用基于序列的方法分析物种分类和功能代谢特征。人类微生物组具有高质量的基因集（gene catalog）和基因组[64, 65]，因此我们建议使用HUMAnN2[93]工具并采用基于序列的方法进行物种分类和代谢通路分析，该方法高效且易于操作。但是，这种方法只使用一小部分序列信息，而且分析结果受到已知数据库的限制[66]。如果需要发现新物种或基因功能，则需要进行第三步。有几个好的软件工具可以用于将纯净序列组装为重叠群（contigs），例如MEGAHIT[94]和metaSPAdes[95]。然后通过MetaProdigal[96]或Prokka[97]从长序列中预测基因。另外，其他软件工具也可以用于从短序列中预测编码基因，例如MetaGeneAnnotator[98]、MetaGeneMark[99]、Glimmer-MG[100]、MetaGUN[101]、FragGeneScan[102]和Orphelia[103]。为了减少重复基因，在分析多个样品或批次时需要使用CD-HIT构建非冗余基因集[104]。通过采用Bowtie 2[92]或Salmon[105]工具进行比对的方法可以计算基因丰度。目前至少有20个软件工具可用于宏基因组数据物种分类[106]。我们建议使用超快速分类器Kraken 2，它可以提供快速、准确和“种”级别的分类结果[107]。至于功能注释，许多研究人员都推荐使用DIAMOND[108]，它是一种快速、敏感的蛋白质比对工具[108]。每个数据库都提供了独特的功能视角，例如，京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）[109]、EggNOG（一个提供直系同源关系、功能注释和基因进化历史的数据库）[110]、碳水化合物活性酶数据库（Carbohydrate-Active enZYmes Database, CAZy）[111]、致病菌的毒力因子（Virulence Factors of Pathogenic Bacteria, VFDF）[112]和综合抗生素抗性数据库（Comprehensive Antibiotic Resistance Database, CARD）[113]。宏基因组通常包含100~1000个物种[64]，很难厘清彼此关系。分箱算法可以恢复无法培养的高丰度菌的基因组草图，并重建系统发育和代谢通路。最后一步是使用metaWRAP[114]或DASTool[115]执行分箱流程（图4C）。这些软件工具有逐步操作教程，并且在其网站上提供了有关人类微生物组的一些样本数据集[81]。另外，几个集成的分析流程，例如MOCAT 2[116]、bioBakery[98]、IMP[117]和微生物组助手（Microbiome Helper）[118]，可以执行上述部分或全部分析步骤。你可以在微信公众号“宏基因组”中找到一些受欢迎软件的中文教程。现在你已经获得了物种分类和功能信息文件。通过STAMP或LEfSe可以轻松找到你感兴趣的生物标记[119, 120]。使用R语言或ImageGP（http://www.ehbio.com/ ImageGP）可以将所有结果可视化。图4：人类微生物组研究的生物信息学分析流程（A）扩增子数据分析的主要步骤。（B）扩增子数据预处理的典型流程图：从原始的双端序列到纯净的扩增子。（C）宏基因组测序数据的分析流程。（a）预处理。它涉及删除低质量序列、接头和宿主序列。输出文件是纯净序列。（b）基于序列的分析。它将序列与数据库比对来推断物种分类和代谢特征。（c）基于组装的分析。它将短序列组装为长序列，预测基因，构建非冗余基因集，并与数据库比对进行物种分类和功能注释。（d）分箱。它涉及恢复未培养微生物的基因组草图，并重建系统发育和代谢通路。KEGG：京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes）；eggNOG：基因进化谱系：非监督直系同源群（Evolutionary genealogy of genes: non-supervised orthologous groups）；CAZy：碳水化合物活性酶数据库（Carbohydrate-active enzymes database）；CARD：抗性基因综合数据库（Comprehensive antibiotic resistance database）；VFDB：毒力因子数据库（Virulence factor database）。7. 病毒组在人类疾病中的作用近年来病毒组在人类疾病中的作用吸引了医学研究者的关注[121]。使用病毒组学的方法已发现了许多令人信服的研究成果[122]，其中一些技术已经用于临床[123]。在微生物组研究中，病毒组学与其他多组学方法整合后显示出广阔的应用前景。但是，病毒组学研究仍然面临一些挑战。例如，至少40％的病毒序列无法注释[124]。此外，病毒的测序结果容易受到背景噪音的影响[17]。最后，很难获得用于病毒组研究的商业化阳性对照，即病毒模拟群落[16]。8. 总结和结论本文讨论了用于微生物组研究的研究设计、样本收集、统计方法和生物信息学分析方法。在“研究设计”部分，我们强调了研究设计的重要性，特别是设计方案、样本量计算以及用于提高研究可靠性的多种措施。研究设计非常重要，因为不好的研究设计可能会产生无意义的数据。在“统计分析”部分，我们介绍了详细的多重比较P值校正方法。选择合适的统计方法对于准确解释微生物组数据很重要。最后，“生物信息学分析”部分介绍了用于分析微生物组数据分析的方法。本文图中使用的脚本可从 https://github.com/YongxinLiu/Qian2020CMJ 获得。综上所述，对于微生物组研究而言，严谨的研究设计在获得有意义的结果方面具有举足轻重的作用，而适当的统计方法对于准确解释微生物组数据非常重要。循序渐进的分析流程为研究者掌握最新生物信息学分析方法提供了帮助。参考文献略，详见原文Xu-Bo Qian, Tong Chen, Yi-Ping Xu, Lei Chen, Fu-Xiang Sun, Mei-Ping Lu & Yong-Xin Liu. (2020). A guide to human microbiome research: study design, sample collection, and bioinformatics analysis. Chinese Medical Journal Publish Ahead of Print, doi: https://doi.org/10.1097/cm9.0000000000000871相关文章Protein Cell：扩增子和宏基因组数据分析实用指南遗传：微生物组数据分析方法与应用刘永鑫：想学菌群生物信息分析-21分钟带你入门收起
广东医科大学2021年硕士研究生招生简章

广东医科大学是广东省属重点建设大学，是博士学位、硕士学位授权单位。现有博士学位授权一级学科1个（临床医学），硕士学位授权一级学科6个（临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、医学技术、药……展开

广东医科大学是广东省属重点建设大学，是博士学位、硕士学位授权单位。现有博士学位授权一级学科1个（临床医学），硕士学位授权一级学科6个（临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、医学技术、药学、生物学），硕士专业学位授权类别3个（临床医学、公共卫生、药学）。学校总面积近1900亩，由湛江校区、东莞校区两部分组成。湛江校区位于富有亚热带风情的沿海开放城市湛江市；东莞校区位于国家级高新技术开发区—东莞市松山湖科技产业园区。一、招生专业、招生人数、学制及学习方式招生专业、招生人数详见《广东医科大学2021年硕士研究生招生专业目录》，招生专业目录中公布的招生人数仅供参考，最终招生人数以教育部实际下达招生计划为准。招生专业按类别可分为学术学位和专业学位。学制3年，学习形式为“全日制脱产学习”。二、报考条件1.中华人民共和国公民。2.拥护中国共产党的领导，品德良好，遵纪守法。3.身体健康状况符合国家和我校规定的体检要求。4.考生的学业水平必须符合下列条件之一：（1）国家承认学历的应届本科毕业生（含普通高校、成人高校、普通高校举办的成人高等学历教育应届本科毕业生）及自学考试和网络教育届时可毕业本科生。考生在2021年9月1日前必须取得国家承认的本科毕业证书或教育部留学服务中心出具的《国（境）外学历学位认证书》，否则录取资格无效。（2）具有国家承认的大学本科毕业学历的人员（须在报名现场确认截止日期前取得毕业证书）。（3）已获硕士、博士学位的人员。在校研究生报考须在报名前征得所在培养单位同意。三、报考要求1.考生须按照与本科毕业专业相关或相近专业进行报考。2.基础医学专业除了接受本科为基础医学专业的考生报考外，还接受临床医学、口腔医学、药学、公共卫生与预防医学、生物学、护理学、生物信息学、医学技术等相关学科专业的本科毕业生报考。3.临床医学类专业报考要求（1）临床医学类学术学位（专业代码为“1002**”）要求：临床医学只接受本科为医学门类和理学门类专业的考生报考；（2）临床医学类专业学位（专业代码为“1051**”）要求：临床医学（除精神病与精神卫生学、放射影像学、超声医学、临床检验诊断学、妇产科学、眼科学和麻醉学以外各专业）只接受本科为西医临床医学的考生报考；精神病与精神卫生学（105105）只接受本科为西医临床医学、精神医学（医学学位）专业的考生报考；放射影像学（105123）只接受本科为西医临床医学、医学影像学（医学学位）、放射医学（医学学位）专业的考生报考；超声医学（105124）只接受本科为西医临床医学、医学影像学（医学学位）专业的考生报考；临床检验诊断学（105120）只接受本科为西医临床医学、医学检验（医学学位，仅限2012年12月31日以前入学）专业的考生报考；妇产科学（105115）只接受本科为西医临床医学、妇幼保健医学（医学学位，仅限2014年12月31日以前入学）专业的考生报考；眼科学（105116）只接受本科为西医临床医学、眼视光医学（医学学位）专业的考生报考；麻醉学（105118）只接受本科为西医临床医学、麻醉学（医学学位）专业的考生报考。（3）专升本医学本科毕业生，其本科专业必须与专科专业相同或相近，方可报考专业学位。（4）报考临床医学类专业学位的考生可调剂到其他专业，报考其他专业的考生不可调剂到临床医学类专业学位。（5）被录取为临床医学硕士专业学位的学生，均须参加临床住院医师规范化培训。已经获得住院医师规范化培训合格证书的考生，或已录取为住院医师规培人员后无故不报到或报到后无故自行退出者，不得报考临床医学类专业学位。4.药学（学术型、专业型）除了接受本科为药学专业的考生报考外，还接受化学、生物学、基础医学、临床医学、中药学等相关学科专业的考生报考。5.公共卫生与预防医学、公共卫生除了接受本科为公共卫生与预防医学专业、公共卫生专业的考生报考外，还接受临床医学、卫生事业管理等相关学科专业的考生报考。6.生物学接受植物学、动物学、发育生物学、基础医学、临床医学等相关学科专业的考生报考。7.医学技术除了接受本科为医学检验技术、医学影像技术、病理技术等专业的考生报考外，还接受临床医学、临床营养学、听力学、眼视光学、康复治疗学、生物学、动物实验学等相关学科专业的考生报考。8.报考“退役大学生士兵计划”的考生，应为高校学生应征入伍退出现役，且符合我校报考条件者。四、报名报名包括网上报名和网上确认（现场确认）两个阶段。所有参加硕士研究生招生考试的考生均须进行网上报名，并在网上或到报考点现场确认网报信息和采集本人图像等相关电子信息，同时按规定缴纳报考费。（一）网上报名1.报名时间2020年10月10日-10月31日，每天9:00-22:00。报名期间，考生可自行修改网报信息。网上预报名时间为2020年9月24日-9月27日，每天9:00-22:00。2.报名流程考生登录“中国研究生招生信息网”浏览报考须知，按教育部、省级教育招生考试管理机构、报考点以及我校的网上公告要求报名。报名期间，考生可自行修改网上报名信息或重新填报报名信息，但一位考生只能保留一条有效报名信息。逾期不再补报，也不得修改报名信息。3.报考点应届本科毕业生原则上应选择就读学校所在地省级教育招生考试机构指定的报考点办理网上报名和网上确认（现场确认）手续；其他考生应选择工作或户口所在地省级教育招生考试机构指定的报考点办理网上报名和网上确认（现场确认）手续。4.注意事项：（1）教育部在报名期间将对考生学历（学籍）信息进行网上校验，考生可上网查看学历（学籍）校验结果。考生也可在报名前或报名期间自行登录“中国高等教育学生信息网”查询本人学历（学籍）信息。未能通过学历（学籍）网上校验的考生应在网上确认（现场确认）后一周内须向我校研招办提供权威机构出具的认证报告。（2）考生应认真了解并严格按照我校报考条件及相关政策要求选择填报志愿。报考资格审查将在报名、复试及录取阶段进行。凡不符合报考条件的考生将被取消报考、复试以及录取等资格，已入校的学生将被取消学籍。（3）网上报名有关具体要求和注意事项，详见《2021年全国硕士研究生招生工作管理规定》和《2021年全国硕士研究生招生考试公告》。（4）考生应按要求准确填写个人网上报名信息并提供真实材料。考生在提交报考信息时，通讯地址必须详细到省、市、区(县)、街道门牌号，调档函、录取通知书等均按考生所提供的网报地址和手机号邮寄。考生因网报信息填写错误、填报虚假信息而造成不能考试、复试或录取的，后果由考生本人承担。（二）网上确认（现场确认）1. 网上确认（现场确认）时间网上确认（现场确认）时间由各省级教育招生考试机构根据国家招生工作安排和本地区报考组织情况自行确定和公布。请考生及时查看报考点公布的确认方式，如所在报考点为网上确认的方式，考生应按照报考点要求准备相关资料。请考生及时关注各省级教育招生考试机构发布的公告，在规定时间内在网上或到报考点指定地点现场核对并确认其网上报名信息，逾期不再补办。2. 网上确认（现场确认）程序（1）考生网上确认（现场确认）应当提交本人有效居民身份证、学历学位证书（应届本科毕业生持学生证）和网上报名编号，由报考点工作人员进行核对。报考“退役大学生士兵专项硕士研究生招生计划”退役大学生士兵专项硕士研究生招生计划的考生还应提交本人《入伍批准书》和《退出现役证》。未通过网上学历（学籍）校验的考生，在网上确认（现场确认）时应提供学历（学籍）认证报告。(2)考生要对本人网上报名信息进行认真核对并确认。报名信息经考生确认后一律不作修改，因考生填写错误引起的一切后果由其自行承担。（3）考生按规定缴纳报考费。（4）考生按报考点规定配合采集本人图像等相关电子信息。（三）打印准考证1.打印准考证时间2020年12月19日-12月28日。逾期不再补办。2.凭网报用户名和密码登录“研招网”自行下载打印《准考证》。《准考证》使用A4幅面白纸打印，正反两面在使用期间不得涂改或书写。考生凭下载打印的《准考证》及有效居民身份证参加初试和复试。3.注意事项根据教育部规定，我校将对考生报考信息和网上确认（现场确认）材料进行全面审查，确定考生的考试资格。考生填报的信息与报考条件不符的，不得准予考试。五、考试（一）初试1. 初试日期、时间和地点2020年12月26日-12月27日（每天上午8:30-11:30,下午14:00-17:00）。考试时间以北京时间为准。12月26日上午 101 思想政治理论12月26日下午 201 英语一12月27日上午业务课一12月27日下午业务课二考试地点：考生网上确认（现场确认）的报考点指定的考场。2.初试科目初试科目详见《广东医科大学2021年硕士研究生招生专业目录》。理学门类初试科目为：101思想政治理论、201英语一、701细胞生物学（自命题）和801生物化学（自命题），满分分别为100分、100分、150分、150分。基础医学、临床医学（学术学位）初试科目一般为：101思想政治理论、201英语一、702西医综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。药学（学术学位）初试科目为：101思想政治理论、201英语一、349药学综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。公共卫生与预防医学初试科目为：101思想政治理论、201英语一、353卫生综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。其中卫生事业管理初试科目为：101思想政治理论、201英语一、706卫管综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。医学技术初试科目为：101思想政治理论、201英语一、704医学技术综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。临床医学（专业学位）初试科目为：101思想政治理论、201英语一、306临床医学综合能力（西医），满分分别为100分、100分、300分。公共卫生初试科目为：101思想政治理论、201英语一、353卫生综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。药学（专业学位）初试科目为：101思想政治理论、201英语一、349药学综合（自命题），满分分别为100分、100分、300分。101思想政治理论、201英语一、306临床医学综合能力（西医）为全国统考科目，其余科目为我校自命题。各科考试时间均为3小时。（二）复试1.复试分数线参加复试的考生（含调剂生）必须符合国家确定的一区考生初试成绩基本要求。我校依据教育部有关政策自主确定并公布 “退役大学生士兵”专项计划考生进入复试的初试成绩要求和接受其他招生单位该计划考生调剂的初试成绩要求。我校自主确定并公布临床医学专业学位硕士研究生进入复试的初试成绩要求。2.复试采取差额形式，差额比例一般不低于120%。我校将按照教育部有关规定制定本单位的复试录取办法和实施细则，并提前在研招网或我校网站向社会公布并严格执行。3.复试内容包括（1）笔试：包括专业课和专业外语。（2）面试与实践操作：包括英语听力及口语测试、综合素质测试、临床实践技能或科研创新能力考查。（3）资格审查在复试报到时对考生的居民身份证、学历学位证书、学历学籍核验结果、学生证等报名材料原件及考生资格进行严格审查，对不符合规定者，不予复试。考生学历（学籍）信息核验有问题的，考生应当在规定时间内提供权威机构出具的认证证明，完成学历（学籍）核验。（4）体格检查考生体检工作在考生拟录取后组织进行。（5）思想政治素质和品德考核考核内容包括考生的政治态度、思想表现、道德品质、遵纪守法、诚实守信等方面。复试时考生须提供本人的现实表现等材料，材料需由考生档案所在单位的人事、政工部门加盖印章。我校将依据《国家教育考试考生诚信档案》记录，对考生在报考时填写的考试作弊受处罚情况进行认真核查，将考生诚信状况作为思想品德考核的重要内容和录取的重要依据。对于思想品德考核不合格者，不予录取。六、调剂考生调剂基本条件：1.符合调入专业的报考条件。2.初试成绩符合第一志愿报考专业在调入地区的全国初试成绩基本要求。3.调入专业与第一志愿报考专业相同或相近，应在同一学科门类范围内。4.初试科目与调入专业初试科目相同或者相近，其中初试全国统一命题科目应与调入专业全国统一命题科目相同。5.报考临床医学类专业学位的考生可调剂到其他专业，报考其他专业（含医学学术学位）的考生不可调剂到临床医学类专业学位。临床医学类专业学位硕士研究生初试成绩基本要求作为考生调剂到其它专业的基本成绩要求。注意事项：调剂考生须通过教育部指定的“全国硕士生招生调剂服务系统”进行调剂（退役大学生士兵加分项目考生、享受少数民族政策考生可除外）。未通过该系统调剂的考生一律无法录取。七、录取1.我校根据教育部下达的招生计划、复试录取办法以及考生初试和复试成绩、思想政治表现、身心健康状况等择优确定拟录取名单。录取工作要依法保护残疾考生的合法权益。2.录取类别与就业。硕士研究生录取类别分为定向就业硕士研究生（以下简称定向生）和非定向就业硕士研究生(以下简称非定向生)两种。定向生应当在被录取前与我校、用人单位分别签订定向就业合同。定向生按定向合同就业，在学期间不转工资、户籍关系及人事档案，可享有已签协议的定向单位规定的工资、福利等待遇。非定向生按我校推荐、本人与用人单位双向选择的办法就业。考生因报考硕士研究生与所在单位产生的问题由考生自行处理。若因此造成考生不能复试或无法录取，我校不承担责任。3.应届本科毕业生及自学考试和网络教育届时可毕业本科生考生，入学时未取得国家承认的本科毕业证书者，录取资格无效。4.新生报到后，我校将进行全面复查，发现有不符合标准者按照有关规定进行处理。八、学费与奖助学金（一）学费1.学费：全日制临床医学类相关学科的学术型硕士研究生（不含定向培养类型）学费标准为8000元/生/学年；专业型硕士研究生（不含定向培养类型）学费标准为16000元/生/学年；全日制非临床医学类相关学科学术型、专业型硕士研究生学费标准为8000元/生/学年；全日制学术型定向培养硕士研究生学费标准为20000元/生/学年；全日制专业型定向培养硕士研究生学费标准为24000元/生/学年。2.住宿费：每生每学年1500元左右（4人间）。3.教材费：自理。（二）奖助学金学校现有国家奖学金、国家学业奖学金、优秀研究生奖学金、优秀研究生干部奖学金、国家助学金，按照相关文件发放。九、信息公开公示1.“研招网”查询方式：院校信息广东广东医科大学2. 研究生院官网: 广东医科大学研究生院十、招生咨询广东医科大学代码：10571研究生院官网: 广东医科大学研究生院通讯地址：广东省东莞市松山湖科技园区新城大道1号广东医科大学研究生院附近1：广东医科大学2021年硕士研究生招生专业目录附件2：广东医科大学2021年硕士研究生考试自命题科目大纲(考试科目代码：349、353、701、704、706、707、801)附件3：广东医科大学2021年硕士研究生考试自命题科目大纲(考试科目代码：702 )广东医科大2021 年硕士研究生入学考试自命题科目考试大纲考试科目代码：[702]考试科目名称：西医综合Ⅰ.考核目标西医综合考试范围为基础医学中的生理学、生物化学和病理学，临床医学中的内科学（包括诊断学）和外科学。要求考生系统掌握上述医学学科中的基本理论、基本知识和基本技能，能够运用所学的基本理论、基本知识和基本技能综合分析、判断和解决有关理论问题和实际问题。Ⅱ.试卷结构一、考试时间：180 分钟，满分：300 分二、题型结构A 型题第 1~90 小题，每小题 1.5 分，共 135 分第 91~120 小题，每小题 2 分，共 60 分B 型题第 121~150 小题，每小题 1.5 分，共 45 分X 型题第 151~180 小题，每小题 2分，共 60 分Ⅲ.考试内容基础医学约 60%其中生理学约 15%生物化学约 25%病理学约 20%临床医学约 40%其中内科学(含诊断学)约 30%外10%Ⅳ.考试内容与要求一、生理学(一)绪论1.体液、细胞内液和细胞外液。机体的内环境和稳态。2.生理功能的神经调节、体液调节和自身调节。3.体内反馈控制系统。(二)细胞的基本功能1.细胞的跨膜物质转运：单纯扩散、经载体和经通道易化扩散、原发性和继发性主动转运、出胞和入胞。2.细胞的跨膜信号转导：由 G 蛋白偶联受体、离子通道受体和酶偶联受体介导的信号转导。3.神经和骨骼肌细胞的静息电位和动作电位及其简要的产生机制。4.刺激和阈刺激，可兴奋细胞(或组织)，组织的兴奋，兴奋性及兴奋后兴奋性的变化。电紧张电位和局部电位。5.动作电位(或兴奋)的引起和它在同一细胞上的传导。6.神经-骨骼肌接头处的兴奋传递。7.横纹肌的收缩机制、兴奋-收缩偶联和影响收缩效能的因素。(三)血液1.血液的组成、血量和理化特性。2.血细胞(红细胞、白细胞和血小板)的数量、生理特性和功能。3.红细胞的生成与破坏。4.生理性止血，血液凝固与体内抗凝系统、纤维蛋白的溶解。5.ABO 和 Rh 血型系统及其临床意义。输血原则。(四)血液循环1.心肌细胞(主要是心室肌和窦房结细胞)的跨膜电位及其简要的形成机制。2.心肌的生理特性：兴奋性、自律性、传导性和收缩性。3.心脏的泵血功能：心动周期，心脏泵血的过程和机制，心音，心脏泵血功能的评定，影响心输出量的因素。4.动脉血压的正常值，动脉血压的形成和影响因素。5.静脉血压、中心静脉压及影响静脉回流的因素。6.微循环、组织液和淋巴液的生成与回流。7.心交感神经、心迷走神经和交感缩血管神经及其功能。8.颈动脉突和主动脉弓压力感受性反射、心肺感受器反射和化学感受性反射。9.肾素-血管紧张素系统、肾上腺素和去甲肾上腺素、血管升压素、血管内皮生成的血管活性物质。10.局部血液调节(自身调节)。11.动脉血压的短期调节和长期调节。12.冠脉循环和脑循环的特点和调节。(五)呼吸1.肺通气的动力和阻力，胸膜腔内压，肺表面活性物质。2.肺容积和肺容量，肺通气量和肺泡通气量。3.肺换气的基本原理、过程和影响因素。气体扩散速率，通气/血流比值及其意义。4.氧和二氧化碳在血液中存在的形式和运输，氧解离曲线及其影响因素。5.外周和中枢化学感受器。二氧化碳、H+和低氧对呼吸的调节。肺牵张反射。(六)消化和吸收1.消化道平滑肌的一般生理特性和电生理特性。消化道的神经支配和胃肠激素。2.唾液的成分、作用和分泌调节。蠕动和食管下括约肌的概念。3.胃液的性质、成分和作用。胃液分泌的调节，胃的容受性舒张和蠕动。胃的排空及其调节。4.胰液和胆汁的成分、作用及其分泌和排出的调节。小肠的分节运动。5.大肠液的分泌和大肠内细菌的活动。排便反射。6.主要营养物质(糖类、蛋白质、脂类、水、无机盐和维生素)在小肠内的吸收部位及机制。(七)能量代谢和体温1.食物的能量转化。食物的热价、氧热价和呼吸商。能量代谢的测定原理和临床的简化测定法。影响能量代谢的因素，基础代谢和基础代谢率及其意义。2.体温及其正常变动。机体的产热和散热。体温调节。（八）尿的生成和排出1.肾的功能解剖特点，肾血流量及其调节。2.肾小球的滤过功能及其影响因素。3.各段肾小管和集合管对 Na+、C1-、水、HCO-3、葡萄糖和氨基酸的重吸收，以及对 H+、NH3/NH4+、K+的分泌。肾糖阈的概念和意义。4.尿液的浓缩与稀释机制。5.渗透性利尿和球-管平衡。肾交感神经、血管升压素、肾素-血管紧张素-醛固酮系统和心房钠尿肽对尿生成的调节。6.肾清除率的概念及其测定的意义。7.排尿反射。(九)感觉器官1.感受器的定义和分类，感受器和传入通路的一般生理特征。2.眼的视觉功能：眼内光的折射与简化眼，眼的调节。视网膜的两种感光换能系统及其依据，视紫红质的光化学反应及视杆细胞的感光换能作用，视锥细胞和色觉的关系。视力(或视敏度)、暗适应和视野。3.耳的听觉功能：人耳的听阈和听域，外耳和中耳的传音作用，声波传入内耳的途径，耳蜗的感音换能作用，人耳对声音频率的分析。4.前庭器官的适宜刺激和平衡感觉功能。前庭反应。(十)神经系统1.神经元的一般结构和功能，神经纤维传导兴奋的特征，神经纤维的轴浆运输，神经的营养性作用。2.神经胶质细胞的特征和功能。3.经典突触传递的过程和影响因素，兴奋性和抑制性突触后电位，突触后神经元动作电位的产生。4.非定向突触传递(或非突触性化学传递)和电突触传递。5.神经递质的鉴定，神经调质的概念和调制作用，递质共存及其意义。受体的概念、分类和调节，突触前受体。周围神经系统中的乙酰胆碱、去甲肾上腺素及其相应的受体。6.反射的分类和中枢控制，中枢神经元的联系方式，中枢兴奋传播的特征，中枢抑制和中枢易化。7.神经系统的感觉分析功能：感觉的特异和非特异投射系统及其在感觉形成中的作用。大脑皮质的感觉(躯体感觉和特殊感觉)代表区。体表痛、内脏痛和牵涉痛。8.神经系统对姿势和躯体运动的调节：运动传出通路的最后公路和运动单位，牵张反射(腱反射和肌紧张)及其机制，各级中枢对肌紧张的调节。随意运动的产生调。大脑皮质运动区，运动传出通路及其损伤后的表现。基底神经节和小脑的运动调节功能。9.自主神经系统的功能和功能特征。脊髓、低位脑干和下丘脑对内脏活动的调节。10.本能行为和情绪的神经调节，情绪生理反应。11.自发脑电活动和脑电图，皮层诱发电位。觉醒和睡眠。12.学习和记忆的形式，条件反射的基本规律，学习和记忆的机制。大脑皮质功能的一侧优势和优势半球的语言功能。(十一)内分泌1.激素的概念和作用方式，激素的化学本质与分类，激素作用的一般特性，激素的作用机制，激素分泌的调节。2.下丘脑与腺垂体的功能联系，下丘脑调节肽和腺垂体激素，生长激素的生理作用和分泌调节。3.下丘脑与神经垂体的功能联系和神经垂体激素。4.甲状腺激素的合成与代谢，甲状腺激素的生理作用和分泌调节。5.调节钙和磷代谢的激素：甲状旁腺激素、降钙素和 1，25-二羟维生素 D3的生理作用及它们的分泌或生成调节。6.肾上腺糖皮质激素、盐皮质激素和髓质激素的生理作用和分泌调节。7.胰岛素和胰高血糖素的生理作用和分泌调节。(十二)生殖1.睾丸的生精作用和内分泌功能，睾酮的生理作用，睾丸功能的调节。2.卵巢的生卵作用和内分泌功能，卵巢周期和子宫周期(或月经周期)，雌激素及孕激素的生理作用，卵巢功能的调节，月经周期中下丘脑-腺垂体-卵巢-子宫内膜变化间的关系。胎盘的内分泌功能。二、生物化学(一)生物大分子的结构和功能1.组成蛋白质的 20种氨基酸的化学结构和分类。2.氨基酸的理化性质。3.肽键和肽。4.蛋白质的一级结构及高级结构。5.蛋白质结构和功能的关系。6.蛋白质的理化性质(两性解离、沉淀、变性、凝固及呈色反应等)。7.分离、纯化蛋白质的一般原理和方法。8.核酸分子的组成，5 种主要嘌呤、嘧啶碱的化学结构，核苷酸。9.核酸的一级结构。核酸的空间结构与功能。10.核酸的变性、复性、杂交及应用。11.酶的基本概念，全酶、辅酶和辅基，参与组成辅酶的维生素，酶的活性中心。12.酶的作用机制，酶反应动力学，酶抑制的类型和特点。13.酶的调节。14.酶在医学上的应用。(二)物质代谢及其调节1.糖酵解过程、意义及调节。2.糖有氧氧化过程、意义及调节，能量的产生。3.磷酸戊糖旁路的意义。4.糖原合成和分解过程及其调节机制。5.糖异生过程、意义及调节。乳酸循环。6.血糖的来源和去路，维持血糖恒定的机制。7.脂肪酸分解代谢过程及能量的生成。8.酮体的生成、利用和意义。9.脂肪酸的合成过程，不饱和脂肪酸的生成。10.多不饱和脂肪酸的意义。11.磷脂的合成和分解。12.胆固醇的主要合成途径及调控。胆固醇的转化。胆固醇酯的生成。13.血浆脂蛋白的分类、组成、生理功用及代谢。高脂血症的类型和特点。14.生物氧化的特点。15.呼吸链的组成，氧化磷酸化及影响氧化磷酸化的因素，底物水平磷酸化，高能磷酸化合物的储存和利用。16.胞浆中 NADH 的氧化。17.过氧化物酶体和微粒体中的酶类。18.蛋白质的营养作用。19.氨基酸的一般代谢(体内蛋白质的降解，氧化脱氨基，转氨基及联合脱氨基)。20.氨基酸的脱羧基作用。21.体内氨的来源和转运。22.尿素的生成——鸟氨酸循环。23.一碳单位的定义、来源、载体和功能。24.甲硫氨酸、苯丙氨酸与酪氨酸的代谢。25.嘌呤、嘧啶核苷酸的合成原料和分解产物，脱氧核苷酸的生成。嘌呤、嘧啶核苷酸的抗代谢物的作用及其机制。26.物质代谢的特点和相互联系，组织器官的代谢特点和联系。27.代谢调节(细胞水平、激素水平及整体水平调节)。(三)基因信息的传递1.DNA 的半保留复制及复制的酶。2.DNA 复制的基本过程。3.逆转录的概念、逆转录酶、逆转录的过程、逆转录的意义。4.DNA 的损伤(突变)及修复。5.RNA 的生物合成(转录的模板、酶及基本过程)。6.RNA 生物合成后的加工修饰。7.核酶的概念和意义。8.蛋白质生物合成体系。遗传密码。9.蛋白质生物合成过程，翻译后加工。10.蛋白质生物合成的干扰和抑制。11.基因表达调控的概念及原理。12.原核和真核基因表达的调控。13.基因重组的概念、基本过程及其在医学中的应用。14.基因组学的概念，基因组学与医学的关系。(四)生化专题1.细胞信息传递的概念。信息分子和受体。膜受体和胞内受体介导的信息传递。2.血浆蛋白的分类、性质及功能。3.成熟红细胞的代谢特点。4.血红素的合成。5.肝在物质代谢中的主要作用。6.胆汁酸盐的合成原料和代谢产物。7.胆色素的代谢，黄疸产生的生化基础。8.生物转化的类型和意义。9.维生素的分类、作用和意义。10. 原癌基因的基本概念及活化的机制。抑癌基因和生长因子的基本概念及作用机制。11.常用的分子生物学技术原理和应用。12.基因诊断的基本概念、技术及应用。基因治疗的基本概念及基本程序。三、病理学(一)细胞与组织损伤1.细胞损伤和死亡的原因、发病机制。2.的概念、常见的类型、形态特点及意义。3.坏死的概念、类型、病理变化及结局。4.凋亡的概念、病理变化、发病机制及在疾病中的作用。(二)修复、代偿与适应1.肥大、增生、萎缩和化生的概念及分类。2.再生的概念、类型和调控，各种组织的再生能力及再生过程。3.肉芽组织的结构、功能和结局。4.伤口愈合的过程、类型及影响因素。(三)局部血液及体液循环障碍1.充血的概念、分类、病理变化和后果。2.出血的概念、分类、病理变化和后果。3.血栓形成的概念、条件以及血栓的形态特点、结局及其对机体的影响。4.弥散性血管内凝血的概念、病因和结局。5.栓塞的概念、栓子的类型和运行途径及其对机体的影响。6.梗死的概念、病因、类型、病理特点、结局及其对机体的影响。(四)炎症1.炎症的概念、病因、基本病理变化及其机制(包括炎性介质的来源及其作用，炎细胞的种类和功能)。2.炎症的临床表现、全身反应，炎症经过和炎症的结局。3.炎症的病理学类型及其病理特点。4.炎性肉芽肿、炎性息肉、炎性假瘤的概念及病变特点。(五)肿瘤1.肿瘤的概念、肉眼形态、异型性及生长方式，转移的概念、途径及对机体的影响。肿瘤生长的生物学、侵袭和转移的机制。2.肿瘤的命名和分类，良性肿瘤和恶性肿瘤的区别，癌和肉瘤的区别。3.肿瘤的病因学、发病机制、分级、分期。4.常见的癌前病变，癌前病变、原位癌及交界性肿瘤的概念。常见肿瘤的特点。(六)免疫病理1.变态反应的概念、类型、发病机制及结局。2.移植排斥反应的概念、发病机制、分型及病理变化(心、肺、肝、肾和骨髓移植)。3.移植物抗宿主的概念。4.自身免疫病的概念、发病机制及影响因素。5.系统性红斑狼疮的病因、发病机制和病理变化。6.类风湿关节炎的病因、发病机制和病理变化。7.免疫缺陷病的概念、分类及其主要特点。(七)心血管系统疾病1.风湿病的病因、发病机制、基本病理改变及各器官的病理变化。2.心内膜炎的分类及其病因、发病机制、病理改变、合并症和结局。3.心瓣膜病的类型、病理改变、血流动力学改变和临床病理联系。4.高血压病的概念、发病机制，良性高血压的分期及其病理变化，恶性高血压的病理特点。5.动脉粥样硬化的病因、发病机制及基本病理变化，各器官的动脉粥样硬化所引起的各脏器的病理改变和后果。6.心肌病的概念，克山病、充血性心肌病、肥厚阻塞性心肌病及闭塞性心肌病的病理学特点。7.心肌炎的概念、病理学类型及其病理特点。(八)呼吸系统疾病1.慢性支气管炎的病因、发病机制和病理变化。2.肺气肿的概念、分类。慢性阻塞性肺气肿的发病机制、病理变化和临床病理联系。3.慢性肺源性心脏病的病因、发病机制、病理变化及临床病理联系。4.各种细菌性肺炎的病因、发病机制、病理变化和并发症。5.支原体肺炎的病因、发病机制、病理变化和并发症。6.病毒性肺炎的病因、发病机制和病理特点。7.支气管扩张的概念、病因、发病机制、病理变化和并发症。8.硅沉着病的病因、常见类型、各期病变特点及并发症。9.肺泡性损伤及肺间质性疾病的概念、病因、发病机制和病理变化。10.鼻咽癌和肺癌的病因和常见的肉眼类型、组织学类型及它们的特点、转移途径及合并症。(九)消化系统疾病1.慢性胃炎的类型及其病理特点。2.溃疡病的病因、发病机制、病理特点及其并发症。3.阑尾炎的病因、发病机制、病理变化及其并发症。4.病毒性肝炎的病因、发病机制及基本病理变化，肝炎的临床病理类型及其病理学特点。5.肝硬化的类型及其病因、发病机制、病理特点和临床病理联系。6.早期食管癌的概念及各型的形态特点，中晚期食管癌各型的形态特点、临床表现及扩散途径。7.早期胃癌的概念及各型的形态特点，中晚期胃癌的肉眼类型和组织学类型、临床表现及扩散途径。8.大肠癌的病因、发病机制、癌前病变、肉眼类型及组织学类型，分期与预后的关系，临床表现及扩散途径。9.原发性肝癌的肉眼类型、组织学类型、临床表现及扩散途径。10.胰腺炎症及肿瘤性疾病的病因、发病机制及病理特点。(十)造血系统疾病1.霍奇金病的病理特点、组织类型及其与预后的关系。2.非霍奇金淋巴瘤的病理学类型、病理变化及其与预后的关系。3.白血病的病因分类及各型白血病的病理变化及临床表现。(十一)泌尿系统疾病1.急性弥漫性增生性肾小球肾炎的病因、发病机制、病理变化和临床病理联系。2.新月体性肾小球肾炎的病因、发病机制、病理变化和临床病理联系。3.膜性肾小球肾炎、微小病变性肾小球肾病、局灶型节段性肾小球硬化、膜增生性肾小球肾炎、系膜增生新肾小球肾炎的病因、发病机制、病理变化和临床病理联系。4.IgA 肾病及慢性肾小球肾炎的病因、病理变化和临床病理联系。5.肾盂肾炎的病因、发病机制、病理变化和临床病理联系。6.肾细胞癌、肾母细胞瘤、膀胱癌的病因、病理变化、临床表现和扩散途径。(十二)生殖系统疾病1.子宫颈癌的病因、癌前病变(子宫颈上皮内肿瘤)、病理变化、扩散途径和临床分期。2.子宫内膜异位症的病因和病理变化。3.子宫内膜增生症的病因和病理变化。4.子宫体癌的病因、病理变化和扩散途径。5.子宫平滑肌瘤的病理变化、子宫平滑肌肉瘤的病理变化和扩散途径。6.葡萄胎、侵袭性葡萄胎、绒毛膜癌的病因、病理变化及临床表现。7.卵巢浆液性肿瘤、黏液性肿瘤的病理变化，性索间质性肿瘤、生殖细胞肿瘤的常见类型及其病理变化。8.前列腺增生症的病因和病理变化。9.前列腺癌的病因、病理变化和扩散途径。10.乳腺癌的病因、病理变化和扩散途径。(十三)传染病及寄生虫病1.结核病的病因、传播途径、发病机制、基本病理变化及转化规律。2.原发性肺结核病的病变特点、发展和结局。3.继发性肺结核病的类型及其病理特点。4.肺外器官结核病的病理特点。5.流行性脑脊髓膜炎的病因、传播途径、病理变化、临床病理联系和结局。6.流行性乙型脑炎的病因、传染途径、病理变化和临床病理联系。7.伤寒的病因、传染途径、发病机制、各器官的病理变化、临床病理联系、并发症和结局。8.细菌性痢疾的病因、传染途径，急性、中毒性及慢性痢疾的病理特点及与临床病理的联系。9.阿米巴病的病因、传染途径，肠阿米巴病的病理变化及肠外阿米巴病的病理变化。10.血吸虫病的病因、传染途径、病理变化及发病机制，肠道、肝、脾的病理变化。11.梅毒的病因、传播途径、发病机制、病理变化及分期。12.艾滋病的概念、病因、传播途径、发病机制、病理变化及分期。(十四)其他1.甲亢、甲减、甲状腺炎症的病因、病理变化和临床病理联系。2.甲状腺肿瘤的肉眼特点、组织学类型、临床表现和扩散途径。3.糖尿病及胰岛细胞瘤的病因、病理变化和临床病理联系。四、内科学(一)诊断学1.常见症状学：包括发热、水肿、呼吸困难、胸痛、腹痛、呕血及黑便、咯血、昏迷。2.体格检查：包括一般检查、头颈部检查、胸部检查、腹部检查、四肢脊柱检查、常用神经系统检查。3.实验室检查：包括血尿便常规检查，常规体液检查，骨髓检查，常用肝、肾功能检查，血气分析，肺功能检查。4.器械检查：包括心电图检查、X 线胸片、超声波检查(常用腹部 B 超及超声心动图检查)、内镜检查(支气管镜及消化内镜检查)。5.常用临床操作：胸膜腔穿刺术、腹膜腔穿刺术、骨髓穿刺术、腰椎穿刺术、导尿术、心肺复苏。(二)呼吸系统疾病1.肺炎的流行病学、病因和发病机制、分类、临床表现、诊断与鉴别诊断;新型冠状病毒肺炎的流行病学、临床表现、诊断与鉴别诊断、临床分型、病例的发现与报告、治疗、出院标准及出院后注意事项及预防。2.慢性阻塞性肺疾病的病因、发病机制、病理生理、临床表现、实验室和其他检查、诊断与病情严重程度评估、鉴别诊断、并发症、治疗和预防。3.支气管哮喘的病因、发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、分期和分级、鉴别诊断、并发症和治疗。4.支气管扩张症的病因、发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。5.肺脓肿的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。6.肺结核的病因、发病机制，结核菌感染和肺结核的发生与发展(包括结核病分类)、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。7.原发性支气管肺癌的病因和发病机制、临床表现和分期、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。8.间质性肺疾病的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。9.肺血栓栓塞症的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断和分型、鉴别诊断和治疗。10.肺动脉高压与肺源性心脏病的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和防治原则。11.胸腔积液的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。12.气胸的病因和发病机制、临床类型、临床表现、影像学检查、诊断、鉴别诊断、并发症和治疗。13.急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的概念、病因和发病机制、病理生理、临床表现、实验室和其他检查、诊断和治疗(包括无创及有创机械通气)。14.呼吸衰竭的发病机制、病理生理(包括酸碱平衡失调及电解质紊乱)、临床表现及分型、实验室和其他检查、治疗。(三)循环系统疾病1.慢性心力衰竭的病因及诱因、病理生理、类型，心功能分级、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。2.急性左心衰竭的病因、发病机制、临床表现、诊断、鉴别诊断和治疗。3.心律失常的分类及发病机制。期前收缩、阵发性心动过速、扑动、颤动、房室传导阻滞及预激综合征的病因、临床表现、诊断(包括心电图诊断)和治疗(包括电复律、射频消融及人工起搏器的临床应用)。4.心脏骤停和心脏性猝死的病因、病理生理、临床表现和急救处理。5.动脉粥样硬化的流行病学、危险因素、发病机制和防治措施。6.心绞痛的分型、发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和防治(包括介入性治疗及外科治疗原则)。重点为稳定型心绞痛、急性冠脉综合征(不稳定型心绞痛及非 ST段抬高型心肌梗死)。7.急性 ST 段抬高型心肌梗死的病因、发病机制、病理、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断、并发症和治疗(包括介入性治疗原则)。8.原发性高血压的流行病学、病因和发病机制、病理、临床表现及并发症、实验室和其他检查、临床类型、危险度分层、诊断标准、鉴别诊断和防治措施。9.继发性高血压的病因、临床表现、诊断和鉴别诊断。10.原发性心肌病的分类、病因、病理、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。11.心肌炎的病因、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。12.急性心包炎及缩窄性心包炎的病因、病理、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。13.心脏瓣膜病的病因、病理生理、临床表现、实验室和其他检查、并发症和防治措施。14.感染性心内膜炎(自体瓣膜及人工瓣膜心内膜炎)的病因、临床表现、并发症、实验室和其他检查、诊断和治疗。(四)消化系统疾病和中毒1.胃食管反流病的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断和治疗。2.慢性胃炎的病因和发病机制、胃镜及组织学病理、临床表现、诊断和治疗。3.消化性溃疡的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断、治疗、并发症及治疗。4.肠结核的临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。5.结核性腹膜炎的临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。6.炎症性肠病(溃疡性结肠炎、克罗恩病)的临床表现、并发症、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。7.肠易激综合征的病因和发病机制、临床表现、诊断、鉴别诊断和治疗。8.肝硬化的病因、发病机制、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断、并发症和治疗。9.原发性肝癌的临床表现、实验室和其他检查、诊断和鉴别诊断。10.肝性脑病的病因、发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。11.胰腺炎的病因、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。12.上消化道出血的病因、临床表现、诊断和治疗。13.急性中毒的的病因、临床表现及抢救原则。14.有机磷中毒的发病机制、临床表现、实验室检查、诊断和治疗。(五)泌尿系统疾病1.泌尿系统疾病总论：包括肾脏的解剖与组织结构，肾脏的生理功能，常见肾脏疾病检查及临床意义，肾脏疾病常见综合征、肾脏疾病的诊断和防治原则。2.肾小球肾炎(急性、急进性、慢性)的病因和发病机制、病理、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。3.肾病综合征的病因、病理生理、病理分型、临床表现、实验室检查、并发症、诊断、鉴别诊断和治疗。4.IgA 肾病的病因、病理、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。5.尿路感染的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。6.急性肾损伤的病因和发病机制、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。7.慢性肾衰竭的病因和发病机制、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。(六)血液系统疾病1.贫血的分类、临床表现、诊断和治疗。2.缺铁性贫血的病因和发病机制、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。3.再生障碍性贫血的病因和发病机制、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。4.溶血性贫血的分类。常见溶血性贫血(遗传性球形红细胞增多症、红细胞葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症、血红蛋白病、自身免疫性溶血性贫血、阵发性睡眠性血红蛋白尿)的发病机制、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。5.骨髓增生异常综合征的分型、临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。6.急性白血病和慢性髓系白血病的临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。7.淋巴瘤的临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断、临床分期和治疗。8.多发性骨髓瘤的临床表现、实验室及其他检查、诊断及分型和分期、鉴别诊断和治疗。9.出血性疾病概述：正常止血机制、凝血机制、抗凝与纤维蛋白溶解机制及出血性疾病分类、诊断和防治。10.特发性血小板减少性紫癜的临床表现、实验室检查、诊断、鉴别诊断和治疗。(七)内分泌系统和营养代谢性疾病1.内分泌系统疾病总论：包括内分泌疾病的分类、主要症状及体征、主要诊断方法和防治原则。2.Graves 病的病因和发病机制、临床表现(包括特殊临床表现)、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗(包括甲状腺危象的防治)。3.甲状腺功能减退症的分类、病因、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。4.库欣综合征的病因、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。5.原发性醛固酮增多症的病因分类、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。6.嗜铬细胞瘤的临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。7.糖尿病的分型、病因和发病机制、临床表现、并发症、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和综合治疗。8.糖尿病酮症酸中毒及高渗高血糖综合征的发病诱因、病理生理、临床表现、实验室和其他检查、诊断和治疗。(八)风湿性疾病1.风湿性疾病总论：疾病分类、主要症状及体征、主要实验室和其他检查、治疗。2.类风湿关节炎的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。3.系统性红斑狼疮的病因和发病机制、临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。4.干燥综合征的病因和发病机制，临床表现、实验室和其他检查、诊断，鉴别诊断和治疗。5.原发性血管炎概论。贝赫切特病和显微镜下多血管炎的临床表现、实验室和其他检查、诊断、鉴别诊断和治疗。五、外科学 (一)外科总论1.无菌术的基本概念、常用方法及无菌操作的原则。2.外科患者体液代谢失调与酸碱平衡失调的概念、病理生理、临床表现、诊断及防治、临床处理的基本原则。3.输血的适应证、注意事项和并发症的防治，自体输血及血液制品。4.外科休克的基本概念、病因、病理生理、临床表现、诊断要点及治疗原则。5.多器官功能障碍综合征的概念、病因、临床表现与防治。6.疼痛的分类、评估、对生理的影响及治疗。术后镇痛的药物与方法。7.围手术期处理：术前准备、术后处理的目的与内容，以及术后并发症的防治。8.外科患者营养代谢的概念，肠内、肠外营养的选择及并发症的防治。9.外科感染(1)外科感染的概念、病理、临床表现、诊断及防治原则。(2)浅部组织及手部化脓性感染的病因、临床表现及治疗原则。(3)全身性外科感染的病因、致病菌、临床表现及诊治。(4)有芽胞厌氧菌感染的临床表现、诊断与鉴别诊断要点及防治原则。(5)外科应用抗菌药物的原则。10.创伤的概念和分类。创伤的病理、诊断与治疗。11.烧伤的伤情判断、病理生理、临床分期和各期的治疗原则。烧伤并发症的临床表现与诊断、防治要点。12.肿瘤(1)肿瘤的分类、病因、病理及分子事件、临床表现、诊断与防治。(2)常见体表肿瘤的表现特点与诊治原则。13.移植的概念、分类与免疫学基础。器官移植。排斥反应及其防治。14.麻醉、重症监测治疗与复苏(1)麻醉前准备内容及麻醉前用药的选择。(2)常用麻醉的方法、药物、操作要点、临床应用及并发症的防治。(3)重症监测的内容、应用与治疗原则。(4)心、肺、脑复苏的概念、操作要领和治疗。收起
还没发论文？2020年医学生信分析有这些！

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Hello，各位小伙伴们，我们是科研菌！！"科研菌"团队每天为您提供高质量的原创科研论文精读, 期刊投稿, 资源分享和文章；每天一篇文章深度剖析，给您更开阔的科研思路。关注科研菌回复"1"即可获取"28G全网最全科研绘图素材"、"谷歌上网助手"(梯子)"和"科研常用软件合集"、“肿瘤/消化内科指南”、"考研复试大礼包"；回复2020，可获得2020年生信套路合集；回复“单细胞文献”，可获得单细胞文献合集。以上资源均(无需转发/集赞)今天科研菌为大家带来2020年生信套路合集(更新版)，一起看下Outline吧一. 生信友好杂志详解1.被“灌水”的Aging(IF=5.515)还能不能投？带你了解 ①Aging现在的状况如何？②Aging成了纯生信灌水的乐园？2.即将突破5分的Frontiers in Oncology是灌水杂志吗？带你了解 ①Front Oncol发表的生信文章的文章类型为哪几类？②纯生信文章的发表周期如何？3.马上4分年刊近2000的杂志JCB：对纯生信友好还不要版面费！一文速览 ①JCB的纯生信文章分类 ②投稿建议4.年刊量3000篇预计5+分的JCP一文速览 ①JCP的投稿类型范围 ②纯生信文章分类 ③投稿周期5.推荐一本生信友好并且最快1月接受的5+分杂志二.生信思路详解1.如何筛出一篇5分文章的核心基因①数据集筛选原则 ②举例(Case1:肿瘤预后基因; Case2:Risk Score; Case3:耐药基因)2.筛到5分的核心基因以后你可以怎么做？①Case1:预后标志物+免疫浸润; ②Case2:单基因多组学验证生存; ③Case3:基因突变+TMB+免疫浸润3.国自然前期研究基础不足？你可以这样补一些生信分析①理清研究方向 ②举例 ③生信分析注意事项 4.非肿瘤生信分析：来不及解释了快上车！①GEO数据库是什么呢？②GEO数据库里有多少非肿瘤的数据呢？③非肿瘤生信GEO的数据挖掘有什么获益呢？④入门GEO数据挖掘你需要做什么呢？⑤在线分析网站推荐+生信数据库合集推荐+生信扩展工具合集推荐三.生信文章详解(标志物&分型&建模)常规转录组类(一)表达谱预后胶质瘤双基因预后标志物就能3+了?A robust twogene signature for glioblastoma survival prediction肾癌之自噬基因预后预测模型发5+分Autophagy-related gene P4HB: a novel diagnosis and prognosis marker for kidney renal clear cell carcinoma肾癌EMT基因预后标志物发5+分Prognostic value of epithelial-mesenchymal transition markers in clear cell renal cell carcinomae9+纯生信泛癌预后标志物筛选Landscape of cancer diagnostic biomarkers from specifically expressed genes纯生信新套路：肺鳞癌TP53基因signatureA TP53-associated gene signature for prediction of prognosis and therapeutic responses in lung squamous cell carcinoma5分+的单基因综合分析还几乎零代码Identification of PGRMC1 as a Candidate Oncogene for Head and Neck Cancers and Its Involvement in Metabolic Activities(二)肿瘤免疫微环境或免疫相关类围观：为什么别人的免疫浸润能发9+分？Immune cell infiltration-based signature for prognosis and immunogenomic analysis in breast cancer5+易学套路: 基因突变+TMB+免疫浸润EP300 mutation is associated with tumor mutation burden and promotes antitumor immunity in bladder cancer patients纯生信4+膀胱癌免疫微环境思路分享Screening and Identifying Immune-Related Cells and Genes in the Tumor Microenvironment of Bladder Urothelial Carcinoma: Based on TCGA Database and Bioinformatics单基因结合免疫浸润的新思路Immune-related key gene CLDN10 correlates with lymph node metastasis but predicts favorable prognosis in papillary thyroid carcinoma一看就会的3+典型免疫浸润表型Immune gene expression profiling reveals heterogeneity in luminal breast tumorsNat Commun: 肿瘤淋巴细胞浸润算法预测黑色素瘤生存An open source automated tumor inltrating lymphocyte algorithm for prognosis in melanoma一学就会的5+分免疫基因与乳腺癌异质性分析Immune gene expression profiling reveals heterogeneity in luminal breast tumors(三)ceRNA膀胱癌ceRNA的3+分思路Identication of the Key Factors Related to Bladder Cancer by lncRNA-miRNA-mRNA Three-Layer Network别人的膀胱癌ceRNA如何做出新花样?Identification of a potentially functional circRNA–miRNA–mRNA regulatory network for investigating pathogenesis and providing possible biomarkers of bladder cancer三张图的miRNA简单分析如何发6分？Model-Based Integration Analysis Revealed Presence of Novel Prognostic miRNA Targets and Important Cancer Driver Genes in Triple-Negative Breast Cancers单细胞转录组类在Aging上发表的胃癌单细胞测序做了什么？Single-cell RNA sequencing of immune cells in gastric cancer patients仅3个单细胞测序样本纯分析也发6分！Single-cell RNA sequencing of human kidney纯生信新冠思路：单细胞测序分析口腔粘膜ACE2表达High expression of ACE2 receptor of 2019-nCoV on the epithelial cells of oral mucosaNat Commun：乳腺癌单细胞测序深度解析Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancerNat Med：一个病例带你了解单细胞测序如何指导临床治疗Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-inced hypersensitivity syndrome: a case report表观遗传类(一)m6A15+分的纯生信：胃癌m6A和肿瘤免疫微环境m6A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvironment infiltration characterization in gastric cancer易学版m6A：肾癌预后和机制分析m6A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvironment infiltration characterization in gastric cancer(二)甲基化5+乳腺癌表观遗传深度剖析Methylome and transcriptome analyses reveal insights into the epigenetic basis for the good survival of hypomethylated ER-positive breast cancer subtype干湿结合类干湿结合上6+高渗基因与透明细胞肾癌预后Hypertonicity-Affected Genes Are Differentially Expressed in Clear Cell Renal Cell Carcinoma and Correlate with Cancer-Specific Survival干湿结合的miRNA调控网络发7+也不难A regulatory microRNA network controls endothelial cell phenotypic switch ring sprouting angiogenesislncRNA简配版干湿结合发5+分The lncRNA ENSG00000254041.1 promotes cell invasiveness and associates with poor prognosis of pancreatic ctal adenocarcinoma肿瘤学套路如何逆袭JCSM10+顶刊Adipose depot gene expression and intelectin-1 in the metabolic response to cancer and cachexia基因组类Genome Med一文带你学会胚系突变与泛癌预后思路The pan-cancer landscape of prognostic germline variants in 10,582 patients一文就懂子宫内膜癌的POLE突变如何发病理学顶刊Interpretation of somatic POLE mutations in endometrial carcinomaJTO：日本非吸烟肺癌患者基因组综合分析Identification of Novel CD74-NRG2α Fusion From Comprehensive Profiling of Lung Adenocarcinoma in Japanese Never or Light Smokers2020年的可变剪切有什么不一样？Profiles of prognostic alternative splicing signature in hepatocellular carcinoma单基因分析新思路：联合ChIP-SeqNR2F2 Orphan Nuclear Receptor is Involved in Estrogen Receptor Alpha-Mediated Transcriptional Regulation in Luminal A Breast Cancer Cells非肿瘤生信类非肿瘤纯生信：STAT1和结核感染的机制挖掘STAT1 and its related molecules as potential biomarkers in Mycobacterium tuberculosis infection科研菌始终都在，陪你度过漫漫科研路希望志同道合的小伙伴就像科研“菌”一样不断裂变，越来越多▲ 长按二维码“识别”关注设置为星标科研菌团队每天为您提供高质量的原创科研论文精读、期刊投稿、资源分享和文章；每天一篇文章深度剖析，给您更开阔的科研思路。关注科研菌回复"1"即可获取"28G全网最全科研绘图素材"、"谷歌上网助手"(梯子)和"科研常用软件合集"、“肿瘤/消化内科指南”、"考研复试大礼包"；回复2020，可获得2020年生信套路合集；回复“单细胞文献”，可获得单细胞文献合集。以上资源均(无需转发/集赞)福利关注科研菌，公众号后台回复“2020”，即可获得科研菌2020年最新生信套路合集PDF版！收起
2021年上半年生物学领域学术会议汇总

马上就要迎来2021年新春长假啦，长假过后，一大波生物领域学术会议即将来袭。小编对2021年上半年生物领域学术会议进行了整理汇总，方便大家更好的选择参会。2月2021 生物医学技术国际会议会议日期：……展开

马上就要迎来2021年新春长假啦，长假过后，一大波生物领域学术会议即将来袭。小编对2021年上半年生物领域学术会议进行了整理汇总，方便大家更好的选择参会。2月2021 生物医学技术国际会议会议日期：2021年2月25-28日会议地点：线上会议2021年第七届生物技术与农业工程国际会议(ICBAE 2021)时间：2021年2月23-25日，新加坡第八届化学与生物科学国际会议时间地点：2021年2月25日-28日，日本东京3月第十一届生物医学工程与技术国际会议(ICBET 2021)时间：2021年3月17-20日，日本4月中国细胞生物学学会2021年全国学术大会时间：2021年4月13-16日中国重庆第五届环境化学与生态毒理学国际研讨会(CECE 2021)时间：2021年4月23-25日中国西安5月第三届国际微生物被膜会议(Asia-Pacific Biofilms 2021)时间：2021年5月11-16日，中国广州环境工程与微生物国际研讨会（第三届国际微生物被膜会议分会）时间：2021年5月12-13日，中国广州2021年第十三届生物信息学和生物医学技术国际会议(ICBBT 2021)时间：2021年5月21-23日，中国西安2021年第九届IEEE生物信息学与计算生物学国际会议(ICBCB 2021)时间：2021年5月25-27日，中国太原2021年生物信息与智能计算国际研讨会（BIC 2021）时间：2021年5月29-31日，中国桂林2021第五届化学与生物化学工程国际会议（CHEMBIO2021）时间地点：2021年5月29-31日，中国武汉6月2021年第三届资源与环境科学国际会议(ICRES 2021)时间：2021年6月5-7日，泰国曼谷注：以上会议信息来自于互联网，由于网络的不确定性，请老师们谨慎选择参会哦！您可能还喜欢：研究思路｜微生物组+代谢组多组学应用案例解读（第五期）研究思路｜微生物组+代谢组多组学应用案例解读（第四期）收起
跨学科考研很难，但导师却可能更欢迎，一大优势被看重

考研的选择，最难的应该是跨校跨学科，没有扎实的学科基础，没有便捷的信息收集渠道，还要担心老师是否会喜欢跨学科的考生；复习备考的时间都差不多，但是需要做的工作却多得多，但是为了有更好的发……展开

考研的选择，最难的应该是跨校跨学科，没有扎实的学科基础，没有便捷的信息收集渠道，还要担心老师是否会喜欢跨学科的考生；复习备考的时间都差不多，但是需要做的工作却多得多，但是为了有更好的发展，很多同学还是会做出这样的选择。不过也不必担心，跨学科考研实际上是有一定优势的，不同学科的结合，往往更容易取得成果。学科交叉是创新突破点现在有一个比较时髦的说法：学科交叉，这是一个重要的创新突破点，所以很多一流高校都非常重视。相应地也产生了一些交叉学科或专业，比如化学和物理交叉形成了物理化学或化学物理，物理与生物交叉形成了生物物理等，另外还有生物医学，生物信息学等；这些新兴的交叉学科越来越成为各高校抢占的创新高地。交叉学科的优势和特点交叉学科具有非常突出的优势，它融合了不同学科的范式，推动了以往被专业学科所忽视的领域的研究，打破了专业化的垄断现象，增加了各学科之间的交流，形成了许多新的学科，创造了以“问题解决” 研究为中心的研究模式，推动了许多重要实践问题的解决。而且交叉学科没有特别明显的学科界限，既可以是自然学科交叉，也可以是自然学科和社会学科交叉，也可以是自然科学和人文社会科学内部不同分支学科的交叉而形成的新兴学科，还可以是技术科学和人文社会科学内部不同分支学科的交叉而形成的新兴学科。也就是说他具有广泛的包容性。典型的代表人物比较有代表性的人物是美国科学院院士，中国科学院外籍院士，获得麦克阿瑟天才奖第一位华人女科学家，哈佛大学化学和物理双科教授庄小威，她从本科到博士都学的物理，博士后阶段开始从事与化学、生物学科交叉的研究。她主要的研究成果，又是用物理方法研究生物体系中单个分子或单个粒子的运动表现。多学科的学习和研究没有阻碍她的科研，反而给了她更为广阔的空间和视野，在科研的道路上越走越宽广。跨学科读研会受到老师欢迎考研的时候完全不用担心，导师不愿意接受跨专业考研的考生。只要有一定的相应学科基础，有积极踏实的态度，都会受到老师的欢迎。不同专业的学生可能给导师的课题带来不一样的思路，从而产生新的思维火花，出现新的科研成果。很多高校鼓励本科就进行交叉学科修读不但研究生估计学生进行学科交叉，部分高校在本科阶段就鼓励学生跨学科修读。比如部分高校大一实行通识的基础学科教育，到高年级后方才细分专业，分专业后也允许学生根据个人兴趣爱好，在完成专业课要求外，还可以随意个性化选择课程修读。C9高校之一的中国科学技术大学目前还开设了交叉学科英才班，允许学生在规定的修读年限内，除本专业外，还可以修读另外一门与学科不相关的其他学科，为以后研究生阶段学习打下良好的基础。跨学科读研需要扎实的基础在深造学习的过程中，也很少有同学只会用到单一的学科知识，即便没有跨学科，也可能需要拓展很多相关专业的知识和技能。所以对于有多学科背景的同学，研究生导师不但不会拒绝，还可能更欢迎。但是对于同学自己来说，跨学科读研刚开始可能会面临一定困难，特别是学科跨度较大的情况，可能受限于学科基础，导致长时间疲于补课，找不到突破点的情况。所以即便选择跨学科读研，也要确定自己的基础课程比如数学，物理，化学，计算机，英语等没有太大问题，可以适应不同学科的学习需求。收起
药学专业深度解析！盘点药学考研策略、院校推荐、就业前景……

2017 年：201 万；2018 年：238 万；2019 年：290 万；2020 年：341 万；2021 年：？看到这串数字，相信每一个考研人都不会感到陌生。作为药学人，在踏上考研这条道路时，你有没有做好相应的准备，是……展开

2017 年：201 万；2018 年：238 万；2019 年：290 万；2020 年：341 万；2021 年：？看到这串数字，相信每一个考研人都不会感到陌生。作为药学人，在踏上考研这条道路时，你有没有做好相应的准备，是否抱着必胜的决心与信念，参与到这场残酷的厮杀中呢？接下来，宗师君就为大家逐一盘点药学专业的国家线、备考策略、院校推荐、研究方向、就业前景等内容，希望对准备报考药学专业的小伙伴有所参考！01药学国家线药学学科是一门综合性学科，它涵盖了化学、生物学、物理学、医学、生理学、材料学等多方面学科的知识和内容，涉猎的领域和范围很广。在填报报考志愿的时候，药学属于医学大类，参考的国家线是医学专业的国家线，2020 年医学国家线为 300 分。02考试科目备考策略药学专业的考试科目为：英语（100 分）、政治（100 分）、药学综合（300 分）。如果想要报考药学学硕，就必考英语一，如果想要报考药学专硕，根据报考院校的要求，可能考英语一，也可能考英语二。药学综合作为专业课，是考研备考过程的重中之重。由于药学综合是自命题科目，每个学校的考试内容不一样，所以要根据自己的目标院校的考纲来备考。药学综合的考试内容大致分为三大类：化学类、生物类、药学类。化学类的考试内容为有机化学、分析化学、物理化学、无机化学；生物类的考试内容为生理学、生物化学、微生物学；药学类的考试内容为药物化学、药理学、药剂学、药物分析。化学类的科目复习策略是以刷题为主，在看完一遍书之后要做大量的习题来巩固知识，脑海里要形成知识网络。生物类的科目复习策略是以看书记忆为主，不用做太多的题，需要你反复地去看书和记忆那些琐碎的内容。药学类的科目复习策略是以知识联动为主，要把书上的内容和考纲串联起来。03目标院校推荐药学作为一门应用性很强的专业，全国范围内开设药学专业的院校非常多，同学们在择校时，需要综合考虑院校所在地区、学科强弱、招生人数等因素。宗师君根据地理位置、综合实力、专业实力等因素，为大家进行一个院校推荐。1. 5A 级 5A 级学校属于全国药学专业最强的学校，他们拥有着一流的师资和科研经费，无论是老师还是培养出来的学生都是行业大咖，这个层次的学校是每一个药学人向往的圣地。代表院校：北京大学、中国药科大学、复旦大学、上海交通大学、沈阳药科大学。2. 4A 级4A 级学校属于全国药学专业性价比最高的学校，论绝对强度他们可能比不上 5A 级学校，但是论就业和上升空间，4A 级学校丝毫不逊色于 5A 级学校。代表院校：四川大学、武汉大学、华中科技大学、西安交通大学、浙江大学、山东大学、中山大学。3. 3A 级3A 级学校是那种在当地很有名的学校，如果同学们觉得考 5A 和 4A 级学校难度太大，可以考虑 3A 级的学校，至少就业是不成问题的。代表院校：中国海洋大学、苏州大学、华东理工大学、首都医科大学、天津医科大学。04研究方向简介作为药学专业的考研党，同学们要将自己的兴趣爱好与特长结合起来，理性分析当前市场需求，确定自己想要报考的方向。接下来，宗师君为大家详细介绍药学专业的各个研究方向、未来的就业前景以及毕业生起薪区间，以供大家参考。1. 药物化学药物化学是一门利用化学的概念和方法发现确证和开发药物，从分子水平上研究药物在体内的作用方式和作用机理的学科。研究生三年基本上都泡在实验室里做有机合成实验，天天和甲苯、乙酸乙酯、呋喃等化合物打交道，相对来说毒性比较大，对自己的发量比较重视的同学要谨慎报考药物化学方向啊，因为这个专业比较容易掉头发。常见的研究内容：靶向和免疫治疗药物的设计、合成及生物活性研究；有机合成方法学和药物合成新工艺研究；新药分子设计、合成及生物活性研究；计算机辅助药物设计、合成和生物活性研究；药物合成工艺设计与优化……药物化学的研究生在毕业后一般到药企从事新药研发与生产线工艺优化工作，工资待遇相较其他专业属于较高收入，月薪一般在 11K以上。2. 药剂学药剂学是针对药物制造的综合应用技术学科，主要针对药物剂型开展研究。相较于药物化学的同学，药剂学的同学要幸福许多了，药剂学的实验在所有研究方向中算是最小的啦，平时和一些无机试剂接触的较多，不像药物化学的同学要天天接触有机试剂。不过药剂学对物理化学的基础要求比较大，要想做好药剂学的研究，物理化学的底子必须要打好。常见的研究内容：新型载药系统的体内转运过程和仿生制剂研究；智能/多功能纳米制剂技术研究；新型缓控释与速释制剂研发与产业化；药用辅料的研发及质量评价体系研究；药用功能材料及细胞制剂的研究；药用高分子材料与药物和基因递送系统的研究……药剂学的研究生在毕业后一般到药企从事制剂研发和生产线管理的工作，工资相较药物化学要低一点，月薪在 8~9K 左右。3. 生药学生药学指以生药为主要研究对象，将现代科学和传统中药学的结合起来，运用现代科学的研究体系去研究一些植物药、动物药、矿物药的组成成分和药理作用。这个研究方向最初是由日本传到中国来的，日本人的生药学专业发展得很好，小青龙汤、小柴胡汤等我国著名传统中药方剂，都被优秀的生药学家开发出了新的运用。生药学的同学相较于研究西药的同学，更偏向中药一点，有时候会跟着老师一起爬山采药材，领略祖国的大好河山，借着科研机会顺便旅游，一举两得啊。常见的研究内容：生药鉴定与质量标准；药用植物资源与中药生物技术；中药活性成分与作用机制；中药活性成分发现与创新中药研究；药用植物资源与生物技术……研究生毕业后一般到药企做中成药的研发和配伍工作，月薪在 5~7K 左右。4. 药物分析药物分析是运用化学的、物理学的、生物学的以及微生物学的方法和技术来研究研究药物的化学检验、药物稳定性、生物利用度、药物临床监测和中草药有效成分的定性和定量等的一门学科。药物分析的同学三年研究生读下来以后会怀疑自己不是来读药学，是来搞检验工作的。高效液相色谱、气相色谱、薄层色谱、滴定分析……研究生三年把各种常用的检测方法都用了个遍，优势在于成功地把自己打造成了技术型人才，缺点就是可能会变成一个“操作工”，只会按照标准化流程做事，缺乏一定的创新精神。由于学科本身的一些限制，药物分析同学的创新能力可能确实要比药物化学的同学要弱一点。常见的研究内容：药物质量控制关键技术研究；药物分析新材料与新技术；药物组学分析；药物分析新技术与新材料；仪器分析与药物质量控制；药物现代仪器分析……药物分析的研究生毕业后一般在药企做质量检测的工作，就是我们常说的 QA（品质保证）和 QC（品质控制）。QA 的工作偏向文件管理，QC 的工作偏向实验检测。QA 的月薪比 QC 略高些，QA 在6~9K 左右，QC 在 5~8K 左右。5.微生物与生化药学微生物与生化药学是研究与药学科学相关的微生物学和生物化学的理论、原理和方法及其在新药发现、药物研究、药品生产，药品质量监控与药品临床应用的基础学科。顾名思义，这个研究方向对应的职业就是生物制药。生物制品在未来数十年都会有很大的市场，胰岛素、抗体药、疫苗、血液制品……都需要微生物与生化药学的同学去研究和探索。微生物与生化药学的同学三年基本上都和细胞、菌株打交道，要对实验室里的培养皿小心翼翼，因为你不知道里面到底装着什么。常见的研究内容：微生物药物和生化与生物技术药物的开发与应用；抗感染与免疫调节药物的药效及机制研究；生物新药的基因工程和蛋白质工程研究；抗体药物研究与开发；功能片段和肽疫苗的设计研究；药物合成生物学……微生物与生化药学的研究生在未来很长一段时间内都会比较吃香，随着化学药物的研发遇到瓶颈期，中药的药理机制还没有探究清楚，生物制药迎来了发展的高峰期。微生物与生化药学的研究生毕业后可以从事生物药的研发与创新，收入不会比药物化学的毕业生低，月薪在11K 以上。6.药理学药理学的学科任务是要为阐明药物作用及作用机制、改善药物质量、提高药物疗效、防治不良反应提供理论依据；研究开发新药、发现药物新用途并为探索细胞生理生化及病理过程提供实验资料。一款新药想要顺利研发出来，药理学人才绝对是不可或缺的一部分。I 期临床，II 期临床，III 期临床，IV 期临床，都需要药理学人才的介入。药理学的同学研究生三年基本上都和小白鼠、兔子、牛蛙打交道，平时要做好实验防护，戴好厚手套，不然就要被实验动物咬伤手指了。常见的研究内容：细菌致病机理及疫苗防控；基于动物模型的疾病机理研究和药物的干预作用；分子药理毒理、高通量高内涵药物筛选；肿瘤药理；抗炎免疫药理；肝脏药理、毒理；医学生物信息学；表观遗传药理学……药理学的研究生毕业后一般从事新药研发的临床辅助工作，可以做 CRA、CRC、CMO（首席医学官）等工作。CRA 的月薪在 6~8K 左右，CRC 的月薪在5~7K 左右。CMO 可就是个高薪职业了，一般来说要在药企里工作十几年后才能晋升到这个位置，需要同学们长久地积淀。7. 药物代谢动力学药物代谢动力学简称药代动学或药动学，主要是定量研究药物在生物体内的过程（吸收、分布、代谢和排泄），并运用数学原理和方法阐述药物在机体内的动态规律的一门学科。确定药物的给药剂量和间隔时间的依据，是该药在它的作用部位能否达到安全有效的浓度。药物在作用部位的浓度受药物体内过程的影响而动态变化。药物代谢动力学可以看做是药物分析与药理学、药剂学的结合学科，运用药物分析的方法，建立药剂学的模型，去解决药理学的问题。常见的研究内容：药物靶标发现与确证研究；药物代谢转运系统的调控机理及药物处置研究；转化药动/药效新模型研究；创新药物代谢与动力学研究；内源活性物质代谢调控；中药体内过程和药效物质基础研究；转化药动/药效新模型研究及生理药代动力学……05结语从将来的就业角度来讲，“钱”途最好的专业是药物化学、微生物与生化药学。这两个专业分别涉及到化学药的研发和生物制品的研发，而对于一家大型药企来说，一名优秀的研发人才是不可或缺的。说直白点，读这两个专业可以让你以后走上月薪过万的道路。从研究生期间发论文角度来讲，药物分析是最好发论文的，你只要能摸索出一个新的分析条件或是对色谱柱进行改良，一篇二类以上的论文就手到擒来了。从研究生期间读研的“轻松”角度来讲，药剂学是最轻松的。相比于其他专业的又脏又累，身边萦绕着有机试剂呛人的气味，药剂学的实验比较干净、毒性也比较低。当然了，没有所谓“最好”的专业，也没有所谓“最差”的专业，人各有志。当你踏上考研这条道路时，你就是一个披荆斩棘、一往直前的勇者，胜利终究是属于你的。本篇原创文章由百家号“宗师考研”发布，我们将会持续更新考研及大学生主题的干货文章与上岸经验贴，敬请关注！收起
2018年东北三省考研院校排名

2017年考研初试已经告一段落，对于许多面临调剂及2018年想要考研的同学来说，在院校的选择方面会面临目标不明确，容易出现方向性的错误。不少同学对于东三省已经形成了一种固有的印象：经济落后、环……展开

2017年考研初试已经告一段落，对于许多面临调剂及2018年想要考研的同学来说，在院校的选择方面会面临目标不明确，容易出现方向性的错误。不少同学对于东三省已经形成了一种固有的印象：经济落后、环境恶劣、就业机会匮乏，于是首先将东三省地区的院校排除在外。实际，近年来东北三省的经济已经表现出明显的回温迹象，加之党和国家对于老东北工业基地振兴的高度重视，所以，东北三省还有很大的发展空间，急需全国各类人才的加入。下面，长春文华教育就为大家整理分享东北三省一些主要的院校情况，有兴趣的同学快来围观吧！本图源自：人民网一、吉林大学简介：吉林大学坐落在吉林省省会长春市，是教育部直属的一所全国重点综合性大学，1995年首批通过国家教委“211工程”审批，2001年被列入“985工程”国家重点建设的大学之一。二、哈尔滨工业大学简介：哈尔滨工业大学（简称哈工大）隶属于工业和信息化部，是首批进入国家“211工程”和“985工程”建设的若干所大学之一。如今，学校已经发展成为一所以理工为主，理、工、管、文、经、法等多学科协调发展的国家重点大学。三、大连理工大学简介：大连理工大学简称大工，坐落于滨城大连，是中央直管、教育部直属的副部级全国重点大学，中国著名的“四大工学院”之一，国家“双一流”、“211工程”、“985工程”、“卓越工程师教育培养计划”、“国家大学生创新性实验计划”、“2011计划”和“111计划”重点建设的大学，“卓越大学联盟”、“中俄工科大学联盟”、“中俄交通大学联盟”、“中欧工程教育平台”主要成员，设有“研究生院”和“国家大学科技园”四、东北大学简介：东北大学始建于1923年4月26日，是一所具有爱国主义光荣传统的大学。学校是国家首批“211工程”和“985工程”重点建设的高校，并实现教育部、辽宁省、沈阳市共建的全国重点大学。五、哈尔滨工程大学简介：哈尔滨工程大学坐落于美丽的松花江畔——北国冰城哈尔滨市。2007年，由国防科工委、教育部、黑龙江省人民政府、海军共建，同年教育部批准正式建立研究生院；2011年，进入国家“985工程”优势学科创新平台项目建设高校行列；2017年，进入国家“双一流”建设行列。学校现隶属于国家工业和信息化部，是我国“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用）领域重要的人才培养和科学研究基地。六、东北师范大学简介：东北师范大学，中华人民共和国教育部直属高校，坐落在吉林省长春市。东北师范大学是首批国家“211工程”重点建设大学，国家“985工程优势学科创新平台”高校之一，首批国家“双一流”世界一流学科建设高校；教育部批准设置研究生院的56所高校之一；“111计划”即高等学校学科创新引智计划高校之一；教育部“援疆学科建设计划”40所重点高校之一；教育部直属的六所综合性师范大学之一；国家师范生免费教育和卓越教师培养计划试点高校。七、黑龙江大学简介：黑龙江大学，全国首批“卓越法律与新闻人才教育培养计划”、“海外高层次人才引进计划”、“ 国家建设高水平大学公派研究生项目”、“教育部来华留学示范基地”入选高校。“中国政府奖学金来华留学生接收院校，全国17所国家教育体制改革试点学院所在高校之一。材料科学、工程学、化学等学科ESI（基本科学指标）连续多年排名居全球前1%行列。八、中国医科大学简介：中国医科大学是中国共产党最早创建的院校，唯一以学校名义走完红军两万五千里长征全程并在长征中继续办学的院校，是我国最早进行西医学学院式教育的医学高校之一。中国医科大学是原卫生部部属高等医学院校，2000年改为省部共建学校。2015年获批为辽宁省人民政府、国家卫生计生委、教育部共建高校。九、哈尔滨医科大学简介：学校为国家教育部首批试办七年制高等医学教育的院校之一，是国家第一批卓越医生教育培养计划项目的试点高校。校本部普通高等教育设17个专业：基础医学(“5+2”本硕连续培养)、临床医学(“5+3”一体化、五年制)、口腔医学、儿科学、护理学、麻醉学、药学、预防医学、医学影像学、公共事业管理、法学、生物技术、生物信息学、临床药学、市场营销、卫生监督、生物医学工程。十、东北林业大学简介：东北林业大学创建于1952年7月，原名东北林学院，是在浙江大学农学院森林系和东北农学院森林系基础上建立的，由原国家林业部直属管理。2005年10月经国家发改委、财政部和教育部批准，成为 “211工程”重点建设学校。2011年6月成为国家“优势学科创新平台”项目重点建设高校，2017年9月经国务院批准被列入国家一流学科建设高校行列。2010年11月教育部和国家林业局签署协议、2012年3月教育部与黑龙江省人民政府签署协议，合作共建东北林业大学。以上就是文华根据人民网发布的关于2018年东北地区大学排名前十的院校所做的简单介绍，旨在为广大在职人员提供报考非全日制研究生提供参考，希望对各位有所帮助！收起

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