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搞科研?还是做临床?这个排行榜说了:不矛盾人哭亦哭

搞科研?还是做临床?这个排行榜说了:不矛盾

科技日报记者 张佳星“临床医生在临床实践中有发现、发明以及心得,愿意和别人分享,发表论文是最好的分享方式,这就是为什么我们在繁忙的临床工作之余还努力地撰写论文。”在中国医学科学院主办的首期“由心讲堂”上,中国工程院院士、上海交通大学医学院附属瑞金医院副院长宁光表示,临床医生做的研究应该是临床需求驱动性的研究。搞科研?还是做临床?这个以前对于临床医生地两难选择,追本溯源而言变成了一回事。“论文和专利变成治病救人的需求,整体而言就是诊断和治疗水平的创新。”宁光说。当天,中国医学科学院发布中国医院科技量值(STEM)对全国1660家三甲医院和110家医学院校(学科)的科技量值进行计算,发布了权威排行榜。搞科研?还是做临床?这个排行榜说了:不矛盾!STEM重点选取如期刊论文及引用、专利及转化、标准和指南等9个直接指标考量科技活动的质量、贡献与影响。“我们希望发挥医学科技评价导向作用,导引医学的研究方向。”中国工程院副院长、中国医学科学院院长王辰院士说。尊重临床,让临床医生有发论文分享经验的“欲望”来自全球创新指数的数据显示,中国的创新质量整体不断提升,2019年的创新质量指数从2018年的全球排名17位上升到15位。“目前,我国的科技体量已经完成唯数量的原始积累,评价体系亟待实现向质的转变过渡。”王辰说。让更多的临床医生愿意通过论文的方式分享临床发现和心得,同时让论文发生从量到质的转变,是STEM希望引导的方向。套用那句“源于生活、高于生活”,医学科技创新工作应“源于临床,高于临床”。中国医院STEM旨在形成激励医学科技创新的正确导向,鼓励临床研究,促进医学科技成果向临床应用转化,为高医疗质量理供更有力的科技支撑。STEM指标坚持临床导向。“如果一项扎实的临床研究改变了临床实践指南,并被国际认可和引用,那么是真正体现临床实践价值。”王辰认为,某项研究的重大社会效益和经济效益难以作为临床导向的重要依据。为此,STEM在权重上突出体现了被国际权威指南引用的论文和中国临床指南的研究工作,不仅引导中国临床研究更加符合国际规范,而且充分体现了临床研究对临床实践的指导。澄明医学科技环境,维护良好学术生态医学科技评价是指导医学科技创新与学科发展的风向标。当前医学科技环境对评价工作的开展提出了新的要求——2018年10月,国家科技部、教育部、人力资源和社会保障部、中国工程院等多部门发文开展清理“唯论文、唯职称、唯学历、唯奖项”专项行动。2018年7月,《关于深化项目评审、人才评价、机构评估改革的意见》指出,使人才称号回归学术性、荣誉性本质。王辰表示,科技评价工作的开展须与国家导向一致,防止人才“标签化”,引导学界打破“四唯”释放人才的创新力。STEM淡化了人才“帽子”的指标权重,注重以科技产出的“原始材料”作为测算依据,降低了人才“帽子”等间接指标权重,纳入高被引科学家和高被引学者作为直接指标。“在实际排行计算时,长江学者、杰青等称号保留加分,但大大减低了比重,而高被引学者的则增加了分值比重。”王辰说。高被引学者是指一定时期内所发表的论文在全球范围内被引用频次高的学者,所发表论文一般都具有很强的原创性、颠覆性。同行的引用次数即是对其学术贡献的“用脚投票”。这类学术研究对其他研究也扮演了“甘做阶梯”角色。对于国家常抓不懈的科研诚信建设,STEM也在评价方法的改进上有所体现。“我们将Retraction Watch数据库公布的撤稿论文,以及国家自然科学基金委员会公布的处罚决定纳入考量范围,对学术不端期刊论文和科研项目实施5倍减分处理。”王辰介绍,例如某个论文或者项目本来可以加5分,但如果出现学术不端,那么就会给这个机构减扣25分。2018年度中国医院、医学院校科技量值 (STEM)排行榜2018年度中国医院STEM覆盖全国1660家医院,此次发布综合了29个学科前100位医院排名。综合排名前10位的医院分别是:四川大学华西医院中国人民解放军总医院中国医学科学院北京协和医院浙江大学医学院附属第一医院上海交通大学医学院附属瑞金医院复旦大学附属中山医院华中科技大学同济医学院附属同济医院北京大学人民医院南京医科大学第一附属医院北京大学第三医院在以往发布的医院STEM的基础上,今年首次发布的中国医学院校STEM对全国110所独立医学院校和设立医学学科的综合大学科技量值进行测算,并在指标体系中增加了与高等院校相关的科技指标。综合排名位列前10位的医学院校是:北京协和医学院北京大学医学部上海交通大学医学院复旦大学上海医学院首都医科大学浙江大学(医学学科)四川大学华西医学中心中山大学(医学学科)华中科技大学同济医学院海军军医大学来源:科技日报 文中图片由作者提供编辑:刘义阳审核:朱丽

今天下暗

临床科研医学论文常见的选题方法

医学论文写作是一项严肃、意义重大的工作,既是交流经验、传播科技成果的重要方式,也是衡量一个人学术水平和科研能力的重要标志。在临床科研医学论文写作中,选题是非常重要的问题,因为只有选择了有意义的课题,才有可能收到较好的研究成果,写出较有价值的医学论文。因此,临床科研选题要具有创新性。值得一提的是,所提出的创新,不是相对个人、本单位过去研究工作的水平而言,而是与国内外同行在所研究的领域内相比,第一次提出的见解,这种见解才是创新。或新技术开发,或提出某一假说,或找出新的诊断和治疗方法。因此,赛恩斯编译认为,临床科研要在反复论证实践的基础上进行选题,常见的方法有以下几种:一、模仿和类比是简单、实用的常见方法。在医学科研的选题工作中,可以在充分学习他人的科研实践和自己充分准备的基础上,借助于模仿和类比的方法,提出问题,进行立题。二、以已选定的科研课题为基础,寻找细微的差异扩大选题。在科研实践中一些新的有价值的闪光点,不是以前都能想到的,在课题实施中,可能出现偶然未能预料的现象,对这些偶然现象与细微差别进行分析,形成新的科学假说,一个新的课题产生了。这种巧妙地捕捉课题实施中有价值点的方法,是医学科研选题的有效方法之一。三、选题时改变已有成果的组合因素。科研设计有三要素,即施加因素、研究对象和实验效应,在每个命题中都能找到这三个要素。如果有意地将其中的任何一个成分改变,都可以形成一个新的课题。四、注意各种学科领域的空白点。科学选题中,莫过于填补空白最容易获得成果。发现空白,立即对这方面的历史和现状作全面考证,从中发现问题进行研究。此方法应是临床工作者选择科研题目的首选。五、在有争论的焦点中问题中选题。由于人们看问题的角度不同,受各种主客观因素的影响,对同一问题持不同观点者比比皆是。如果能抓住这些矛盾的焦点,通过临床论证,提出自已的观点和意见,更易受到有关专家的重视。六、结合自己的特长和工作单位选题。这种选题方式是针对自己特长、自己已取得的成绩、能开展的项目为依据,开始阶段选的课题更具有可行性。

客出

中国科协年会:临床与科研 医生当有区分

【光明时评】作者:王强(中国中医科学院望京医院)医生以治病救人为天职,成为一个好医生的前提是医术过硬,但在现实中,医生晋升更重要的任务或许是埋头写论文。日前,在吉林长春举行的中国科协年会上,中国工程院院士、中国中医科学院首席研究员李连达呼吁,医生的首要职责是治病救人,要警惕做1000台手术和救100个病人不如发1篇论文的现象。中共中央政治局委员、国家副主席李源潮在开幕式上讲话。(中国科协供图)目前,我国的医生职称评价体系“重科研、轻临床”,过度提倡医生成为科研型医生,导致出现一些临床水平不高甚至不会治病的医学博士和专家。在目前的晋升体制下,科研成为评职晋升的捷径。为此,很多临床医生对科研工作的重视程度大大提高,花费大量时间和精力进实验室搞科研,还催生了论文造假、数据造假、有偿论文等学术腐败行为。而有些医生的临床能力得到同行的广泛认可,但因为缺乏足够的SCI论文,始终晋升不了高级职称。对医生科研成果的过度重视,既有评价体系不完善的原因,也有不同医院之间科研竞争的角力。在这种大环境下,一些医院唯论文、唯SCI导向评价医生,将其作为医生职称晋升的主要标准,这对基层医院和临床一线的医生明显有失公平。事实上,中共中央去年印发的《关于深化人才发展体制机制改革的意见》就明确提出,要注重凭能力、实绩和贡献评价人才,克服唯学历、唯职称、唯论文等倾向,不将论文等作为评价应用型人才的限制性条件。通过评价机制改革,引导基层医院和临床一线的医生以治病救人为第一要务,不妨借鉴国外经验。在一些发达国家,取得医生的从业资格非常难,而医生又大致分为家庭医生和科研医生两大类——家庭医生占绝大多数,没有科研条件和科研考评要求,只有在大医院的医生才专门从事科研。而且,科研医生并不一定比家庭医生更有诱惑力,比如大名鼎鼎的哈佛大学,其医学院教授的收入比当地私人医生少得多。人的精力是有限的,拿手术刀的医生和做实验、写论文的医生的工作性质差别迥异,评价机制自然应当不同,不能指望医生都成为既能治大病又能搞科研的“全能医生”。区分临床医生与科研医生,让有科研热情的医生专心钻研医学尖端科技,同时给临床能力强的医生公平的竞争舞台,这样的评价机制才能合理评价医生的科研与临床贡献。让医术精湛的临床医生也能得到社会认可,这样才能满足医生和患者的期待,促进医疗事业的长远发展。《光明日报》( 2017年06月28日 02版)

樱花

刘必成教授:我国临床科研从追赶、并跑到领跑 药物创新未来可期

前言:伴随着改革开放的春风,东南大学附属中大医院肾脏科初创于1979年。近年来,东南大学肾脏病研究所在中华肾脏病学会副主任委员、国内肾病专家刘必成教授带领下,狠抓学科建设,紧紧瞄准肾脏病学国际前沿,先后承担多项国家及江苏省重大、重点项目,获得多项国家及省部级成果奖励。与刘必成的对话中,可以明显感受到,他对改革开放有着一种特殊的情感,他称自己既是改革开放的见证者、受益者,更是改革开放事业的参与者、实践者。作为肾脏科医生,刘必成深感荣幸能参与到罗沙司他的三期临床试验,见证“诺贝尔医学奖”研究成果在中国的开花结果,率先惠及中国患者。刘必成认为,我国医院科研发展70年,经历从追赶、并跑到领跑的转变,已经真正实现与国际接轨。在未来科研探索过程中,东南大学附属中大医院将坚持创新合作两手抓,同时帮扶基层一起发展,不断提高医疗水平,为建设健康中国而努力。“我是60年代出生,80年代上大学,90年代出国留学,可以说是国家改革开放的受益者、见证者,也是改革开放事业的参与者和实践者。改革开放四十年是我国医疗卫生发展最快的四十年。四十年中,我们经历了不同的阶段,实现从追赶、并跑到领跑的转变。”90年代,我们在追赶20多年前,出国留学时的所见所闻依然历历在目。刘必成回忆,“90年代初,国外电脑已经普及,信息化程度也很高,教学科研资源和设备都是很先进的,医疗水平也非常高。我们看到国外医院的肾脏科是单独的一幢楼,既有漂亮的病房,也有先进的实验室,几个透析分中心加起来可以容纳800多个透析病人。当时感到很震惊。”回国以后,刘必成一心扑在肾脏科事业上,他说:“看到了与发达国家之间的差距,我们自己发奋图强也有了方向。在过去的二三十年里,最重要还是得益于我国经济的快速腾飞,医疗卫生事业迅速发展,从疾病诊疗水平、就诊环境到医学科研水平,都得到了显著的提高。我们明显地感到和西方发达国家之间的差距在不断缩小。”刘必成指出,改革开放四十年来,我国医学科研工作已经积累了相当好的基础,第一,我国人口多,疾病资源丰富;第二,国家已经培育了一批具有国际视野的临床科研人才,为开展高水平科研工作提供了重要的人力资源保障;第三,现在各级政府都很重视科研创新工作,给予的科研经费也逐年增加,有了很好的物力基础。实施健康中国战略,离不开医学科研创新医学科研为什么这么重要?刘必成介绍,医学科研包括基础科研和临床科研,基础科研提供原创性理论发现,而临床科研就是将这些基础理论转化为实际应用,来解决病人所关心的疾病诊治问题。“所以我觉得,没有临床科研,没有医学研究,就没有我国医学的可持续发展。”刘必成表示:“作为医学工作者,我们如何才能助力实现健康中国?我觉得关键要在重大疾病防治方面实现一系列的创新和突破。以前我们总是跟在别人后面跑,没有自信心。现在我们认识到只有实现创新,才能引领发展,真正地实现独立和自强。因此,医学科研工作的进步对于我们实现健康中国战略是极其重要的。“与国际科研并跑,ICH助力中国科研创新能力提升“现代化的一个重要标志就是国际化水平。科学无国界,我们国家过去四十年取得的巨大成功,得益于改革开放。“2017年,国家药品监督管理局正式成为国际人用药品注册技术协调会(ICH)成员,我国药品监管体系已经真正融入国际社会认可的监管体系中,也为药物临床试验工作打开了全新的局面。“过去我们参加国际会议,看到新药上市,过了十几年,国内还是没有这个新药,那时候觉得很遗憾,我们只是旁观者,并不能参与到其中。”刘必成说,新药开发是一个非常复杂的工作,国际上已经积累了非常丰富的经验,临床上应用的绝大部分西药来自西方,只有和国际全面接轨,我国医药行业才能得到全面提高,人民也能够及时享受现代科技及创新药给健康带来的保证。所以,我国加入ICH,是非常正确的,是我们的医药科技迈向国际化的一个重要举措,意味着我国在ICH规则制定中拥有了话语权和决策参与权,中国医药行业的国际化进程会大大加快。刘必成进一步指出,加入ICH后,在今后的新药临床研究过程中,我们可以积极地争取,尽快地加入到临床试验过程中,最好能同步进行;与此同时,我们要结合国内临床实际情况进行自己的课题设计,拿出适用于中国病人的应用方案,更好地造福中国病人。新药研究获国际认可,中国创新药未来可期根据国家药监局官网消息,1类创新药罗沙司他胶囊(商品名:爱瑞卓)于2018年12月获批上市,用于治疗正在接受透析治疗的患者因慢性肾脏病(CKD)引起的贫血,在中国获批上市之前未在其他任何国家上市。口服药物罗沙司他胶囊是全球首个开发的小分子低氧诱导因子脯氨酰羟化酶抑制剂(HIF- PHI)类治疗肾性贫血的药物。罗沙司他这一首创新药物的研发基于低氧诱导因子(HIF)和氧感应理论的创新突破,2019年诺贝尔生理学或医学奖授予了发现氧气感应机制的三位科学家。作为参与罗沙司他三期临床试验的专家之一,刘必成说,“这次氧感应适应机制获得诺奖,我们肾科医生感到尤其兴奋,因为中国肾科医生在比较早的阶段就参与到罗沙司他的临床试验中来,对这个理论也一直抱有信心。”刘必成表示,“临床多中心研究是新药走向临床的一个重要环节,一个新药不经历二期、三期临床试验是无法真正走向临床的。在过去的二十年里,我国的临床药学研究能力有了长足的进步。罗沙司他两项研究在NEJM发表,这是NEJM首次发表由中国大陆医生作为第一和通讯作者的新药Ⅲ期临床试验,也是NEJM首次背靠背发表中国团队的临床试验。文章的发表印证了氧感应机理在肾性贫血治疗领域的临床应用已走在所有疾病治疗领域前列。我们医院对能作为主要参研单位参与罗沙司他的临床试验非常高兴,也格外重视。我们组建了专门的研究小组,对如何执行GCP规范,确保试验过程的严谨性和研究结果的科学性进行了全程严格的管理,我们成为单中心完成病例数最多、完成质量最好的单位,完成接近整个研究所需样本数的十分之一,多次受到有关部门的称赞。”他补充道。罗沙司他率先在中国完成临床试验,率先在中国获批,引起各界的普遍关注。刘必成认为,这具有里程碑的意义。未来,他呼吁产学研要紧密结合,既要加强基础理论的研究,也要鼓励科学家和企业家之间紧密合作,缩短实验室和工厂的距离,加速科研成果转化,力求更快造福患者。他说:“相信今后中国会有更多世界级的新药或本土原创新药,在中国先研发,先上市,并从中国开始惠及全球病患。”国际合作促创新,国内合作扶基层在科研建设上,东南大学附属中大医院肾脏科注重与国外同行之间的交流合作,“我们通过邀请国外高校和同行定期讲课交流,积极参与国际的学术会议交流,不断开阔视野,了解世界的变化,了解学术的前沿。在学术交流中,我们也感受到在创新意识方面还需要再下一番功夫。作为科研人员,国家为我们提供了创新的沃土,我们医学科技工作者应更具备创新意识与创新热情,心无旁骛地做科研,解决临床问题,解决未被满足的临床需求。“中大医院一直将医教研协同发展作为自己的重要使命,在与国际一流学术机构合作的同时,也重视国内兄弟单位之间的合作。刘必成告诉记者,“客观地讲,我国医疗技术水平参差不齐,中心城市和基层,东部地区和偏远地区之间都还存在不小的差距。作为相对先发展起来的医院,我们有责任有义务来帮助基层医疗机构提高水平。”近些年,东南大学肾脏病研究所作为江苏省肾脏病临床研究中心,建立了60多家基层医院的医疗联合体,通过定期派专家坐诊、查房和远程会诊,解决基层医院医疗工作中的难题,同时为危重病人开通绿色通道。在最后,刘必成说:“我们的合作是不同的层面,既有顶端层面,也有与基层兄弟单位之间的合作。学科建设和发展需要大家相互支持,只有相互支持,携手合作,才能把工作做大做好。健康中国的实现,不能靠大医院一花独放,要靠基层医院万花齐放。只有基层医院都强起来了,我们国家的医疗卫生事业才会是真正地强大。“(东南大学附属中大医院供稿)

小秘密

总是发不出SCI?这篇文章教你“简单科研”丨临床科研

关键词:树突状细胞,Fcγ受体,狼疮性肾炎,系统性红斑狼疮(SLE);生物样本库;前言:我们主张“简单科研”,特别是“临床医生的简单科研”。首先我们都知道中国的临床医生有最丰富的临床科研资源,有最为丰富的临床样本,但是却陷入“发不出SCI论文”的困境中,临床样本弃之如敝履。今天我们以Clinical and Experimental Immunology杂志(IF 3.532)的一篇论文为例分享解析“从临床出发,快速简单的发SCI论文”。该论文的题目是“Dysregulated Fcγ receptor IIa-inced cytokine proction in dendritic cells of lupus nephritis patients”,发表于2019。由阿姆斯特丹风湿病学和免疫学中心完成。在这项研究中,作者将临床样本和基础实验相结合,探讨了在三个不同的组 (即HC健康对照、不伴有肾炎的SLE或伴有肾炎的SLE患者)的DC中 FcγR诱导的I型IFN抑制是否仍起作用,以及FcγR诱导的IL-1β是否也在狼疮性肾炎患者中受损。我们一起学习,作者是怎么做到的。一、研究背景系统性红斑狼疮(SLE)是一种病因不明的复杂自身免疫性疾病。与SLE发病机理相关的关键因素之一是I型干扰素(IFN)的过量产生。这可能是由于I型IFN刺激途径的激活增加,也可能是抑制I型IFN的通路功能受损所致。最近,我们发现免疫球蛋白(Ig)G免疫复合物通过树突状细胞(DCs)上的Fcγ受体IIa(FcγRIIa)抑制信号传导,强烈抑制健康个体中的I型IFN产生。由于在SLE患者中,免疫复合物具有特征性,因此我们评估了FcγR诱导的I型IFN抑制在SLE患者DC中的功能。二、方法及主要结果本研究主要结合临床样本和基础实验从临床医生自身出发,根据自身优势,我们需要了解到的是自己如何设计和完成类似研究。1、狼疮性肾炎患者DCs中Fc r诱导的I型IFN抑制受损本研究纳入22例HCs健康对照和16例临床诊断为SLE的患者,考虑到疾病的异质性,将SLE患者分为两组:一个没有主要脏器受累(n = 8),另一个以前有肾炎受累 (n = 8)。本研究中探讨了SLE患者DC在Fcγ诱导的I型IFN抑制中是否表现出异常。我们研究了一组患有肾炎的病人和一组没有主要器官受累的病人来评估不同组中FcγR诱导抑制的潜在差异。研究表明FcγR诱导的I型IFN抑制在狼疮性肾炎患者的DCs中受损,而在没有主要器官受累的SLE患者中没有受损。图1. 狼疮性肾炎患者树突状细胞(DC)中Fcγ受体IIa(FcγRIIa)诱导的I型干扰素(IFN)抑制受损2、狼疮性肾炎患者FcγRIIa诱导的I型IFN抑制受损不是药物治疗或FcγRs、IRF1和IRF5表达不同引起的由于几乎所有SLE患者都使用特定的药物,I型IFN抑制受损可能与治疗有关。此外,FcγRs在狼疮性肾炎患者中的表达可能存在差异。负责抑制树突状细胞产生IFN-β的主要受体是FcγRIIa,为了在蛋白水平上验证不同组之间的表达水平,作者使用流式细胞术评估了FcγRIIa的表达,因此,作者从药物、FcγRIIa表达、IFN调控转录因子(IRF)1和IRF5评估了两组SLE患者间的差异。研究表明这种受损的I型IFN抑制与疾病活性,药物,FcγRIIa表达或IFN调控转录因子(IRF)1和IRF5的表达无关。图2. 狼疮性肾炎患者中Fcγ受体IIa(FcγRIIa)诱导的I型IFN抑制受损不是由于药物治疗或FcγR,干扰素(IFN)调节转录因子(IRF)1或IRF5表达的差异。3、在狼疮肾炎患者中,FcγRIIa诱导的IL-1β蛋白扩增增加在先前研究中,作者发现FcγRIIa刺激激活了两条平行的途径。Ⅰ型IFN反应受Syk-和PI3K非依赖性信号介导的抑制途径抑制。相反,通过Syk和PI3K的“激活”通路信号,这会放大IL-1β等促炎性细胞因子的产生。正如作者的数据所示狼疮性肾炎患者抑制性途径(抑制I型IFN)受损,随后作者评估了激活途径(增加IL-1β)是否也在狼疮性肾炎患者中受损。研究结果表明狼疮性肾炎患者虽然FcγRIIa诱导的I型IFN抑制受损,但FcγRIIa诱导的IL-1β扩增增加。图3.狼疮性肾炎患者中Fcγ受体IIa(FcγRIIa)诱导的白介素(IL)-1β产生增加三、临床医生的自身优势及准备工作在这项研究中,需要抓住的点在于临床样本和基础实验的结合,这是身为临床医生的自身优势。(1)合作共赢:选题需要熟悉,知识面广,多阅读相关文献领域,了解最新研究进展。基于这些,可以与高校,研究所及公司合作,共同进步,利用前沿技术手段解决问题。(2)课题设计思路:根据要解决的科学问题从临床样本取材,实验分组到实验验证等,一步一步围绕拟解决的问题逐步开展;当然,这些也都可以与高校课题组、研究公司合作完成,提供先进的技术手段。(3)创建样本库:临床医生有最丰富的临床科研资源,有最为丰富的临床样本,这是自带优势。而生物样本库是各种疾病基础与临床研究、临床诊疗、药物靶点治疗研究、健康预防研究以及转化医学等的重要基础。针对临床生物样本库,建立专门的临床生物样本库,为临床样本的收集保存提供了规范化系统,每份样本均粘贴唯一二维码以便于识别,这样的样本库才能做成顶级研究。当然,这些可以和公司合作,有专门的管理系统。一篇文章,首先选题是很重要的一点,针对熟悉的内容临床医生很容易完成。利用自身的资源优势将临床和基础研究相结合(这是我们一直强调的一点),并且在目前大的科研环境下,交叉合作已然是一种趋势,因此,临床医生可以与高校课题组、研究所、公司建立合作关系,最终达到合作共赢的结果。原文链接:Newling M, Renée H. Fiechter, Sritharan L, et al. Dysregulated Fcγ receptor IIa-inced cytokine proction in dendritic cells of lupus nephritis patients [J]. Clinical & Experimental Immunology, 2019, 199(1).

没好死

基于临床科研大数据平台研究

利用人工智能技术建设临床科研大数据平台。采用了Openstack作为数据平台私有云的解决方案,应用层使用Docker容器化的方案,数据库使用了开源数据库软件PostgreSQL,平台的应用主要由科研数据中心、临床大数据治理平台、智能科研检索、临床科研采集系统、全院级科研随访系统五部分组成。通过该平台临床研究人员获取数据将更便捷、科研管理更高效、探索新的研究方向更容易。基于临床科研大数据平台,能为医院各专科提供有效的科研服务,实现科研、论文和核心技术等方面的突破提升。随着医疗体制改革的深入,科研水平成为衡量医院发展水平的重要因素。科研大数据平台作为医院科研、教学工作的一个重要组成部分,在提高临床科研水平和培养医学研究人才方面发挥着十分重要的作用。如何为临床科研人员搭建平台,以有限的资源发挥最大效应,实现资源共享,最大限度地发挥科研支撑平台的作用,是目前大型综合性医院亟需解决的课题。研究背景 2017年国务院发布的《新一代人工智能发展规划》中提出要大力推广应用人工智能治疗新模式新手段,建立快速精准的智能医疗体系。随着大数据和人工智能的运用,国内外涌现了一大批借助医学信息学和机器学习技术进行临床研究数据分析挖掘,取得了丰硕成果。通过对医疗电子化数据的建模、分析、挖掘,并且基于数据二次利用所形成的进一步应用,已经成为医疗信息化、精准化、智能化的下一个核心发展方向。我国健康大数据和医疗人工智能行业尚处于起步阶段,基础薄弱。目前国内最有代表性的医疗人工智能产品,在于基于医疗影像的人工智能自动筛查和诊断系统,对胸片、皮肤照片、脑部影像等医学影像进行自动分析,并生成相应的影像诊断报告。但在其他人工智能的技术领域,例如自然语言处理、语音识别,以及通用的机器学习方法,目前在中国形成可落地的产品尚不多见 。基于临床科研大数据平台的架构与应用目前大部分医院已经建立了较为全面的医疗信息化支撑体系,无论是电子处方、医嘱套餐,还是临床路径、电子病历,在提高临床效率服务上下足了功夫,但由于临床数据分散在多个应用系统中(如EMR、LIS、PACS等),且都是非结构化的海量数据。本文通过人工智能技术的应用进行探讨,为有兴趣致力于研究大数据的临床科研工作者提供一点思路。技术架构研究采用了Openstack作为数据平台私有云的解决方案。通过使用Openstack搭建私有云平台,既可以获得类似阿里云等公有云的灵活、弹性、扩展性等云计算的优势,又可以降低安全风险。在应用层使用Docker容器化的方案。通过使用Docker容器化部署,每个服务运行在了一个独立的环境之中,互不干扰,也不会影响宿主机的环境,解决了长久以来生产环境与开发测试环境不一致导致的各种问题。同时,通过Docker提供的集群化以及资源分配功能,提供了更高的可用性,并提供了不停机升级的特性。数据库使用了开源数据库软件PostgreSQL。PostgreSQL作为当前最先进的开源关系型数据库管理系统,体现了极高的性能与稳定性,支持python、perl、c、R、Java、Javascript、PL/PgSQL等多种语言编写存储语言及扩展,支持多种特殊索引结构、支持自定义的数据结构、支持机器学习库以及GPU并行计算等。基于临床科研大数据平台的应用基于临床科研大数据平台的应用主要由以下几部分构成:科研数据中心、临床大数据治理平台、智能科研检索、临床科研采集系统、全院级科研随访系统等应用(表1)。在此治理和科研采集的基础之上,未来可支持科研统计分析及临床辅助决策。在人工智能支撑下,通过临床辅助决策应用到电子病历等业务系统中,将治疗评价、风险预测贯穿在诊疗流程,基于医院原有临床数据进行实时决策支持,最终实现临床采集-科研分析-指导临床的闭环。表1 临床科研大数据平台应用全院级专病科研数据中心通过将原有院内临床数据中心CDR,未充分结构化的病历、报告等文本数据,经过人工智能技术处理形成高质量、多维度的结构化数据,以满足科研检索、临床数据收集、统计分析的需要。结合科研采集、随访管理等系统采集的数据,进一步丰富“以患者为中心”的科研数据库。临床大数据治理平台基于自然语言处理、知识图谱、机器学习等AI引擎的大数据治理平台,实现各类临床数据的结构化、标准化和归一化等处理。针对数据驱动的临床研究场景,能够将医院积存的海量临床数据自动结构化、标准化成可被临床研究直接分析、利用的科研数据。治理后的结果为后续的临床应用提供了良好的数据基础。智能科研检索提供多维度、多病种符合专病模型的检索功能,从病历、诊断、用药医嘱、检验、检查报告、体征等结构化及非结构化文本中提取检索点位,个性化定制专病检索模型。支持通过入选和排除等集合运算实现研究人群的精确筛选,实现自动发现满足条件的新病人并自动入组,实时精准从海量病历中定位研究人群。临床科研采集系统在数据治理基础上,满足科研所需的病例报告表(CRF)设计与数据采集、科研项目管理、团队管理与多中心、权限设置与隐私、数据核查与质疑、数据导入导出等常见功能模块。高度结构化、规范化的病历数据,利于病例报告单(CRF)自动填写,科研流程管理支持研究全过程协同。全院级科研随访系统可有效解决院内外数据整合、患者依从性差、失访率居高不下的难题,在全面提升随访专业度、保证科研项目的顺利推进的同时,极大地提升科研人员的工作效率。随访平台从患者管理和科研需求出发,整合随访计划提醒、随访量表填写、智能科普患教、在线病情咨询、患者报告结局(ePRO)信息采集等功能;自动问答功能为患者提供准确的知识问答和健康建议,实现个性化健康宣教和科普。同时为满足临床科研需要,可将患者采集结果便捷地返回给专病科研库,实现对患者离院后健康信息的全量收集。结论与展望智能化的临床科研支持系统不仅能对历史病历数据进行快速检索浏览,而且能便捷地将临床数据应用于具体研究中,成为医院各科室开展临床研究提供高效的工具,加速推进学术研究及成果转化,释放积压的大量医疗数据潜在学术价值。同时在全院级临床科研大数据平台与应用平台上,实现了各业务系统历史数据及实时数据的整合、治理。经过治理后的数据保障临床科研数据质量,在此基础上各科室临床研究人员获取数据将更便捷、科研管理更高效、探索新的研究方向更容易,从而实现科研效率整体提升,不断提升学术研究能力,实现医院临床学术研究质和量提升。【引用本文:朱明宇. 基于临床科研大数据平台研究[J]. 中国数字医学,2020,15(7):17-18,35.】新媒体部: 010-81138718;81138717

苟有其实

国内首个肺癌临床科研智能病种库和多学科智能诊断系统发布

6月15日,“华西医院&依图医疗”肺癌人工智能成果发布会重召开,双方合作研发的国内首个肺癌临床科研智能病种库和全球首个肺癌多学科智能诊断系统正式发布。华西依图联合研发的肺癌临床科研智能病种库是国内首个基于人工智能技术的肺癌单病种科研数据库,以患者为中心,收录肺癌患者的影像、病理、基因检测、病历文本等多维数据,通过人工智能技术对数据进行整合,打造真正的医疗大数据。依托这个病种库,华西-依图联合团队,以临床指南为指导,融汇华西医学专家智慧,共同开发了肺癌多学科智能诊断系统。肺癌是中国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。四川大学华西医院院长李为民表示,人工智能正是优质医疗资源的放大器与连接器,通过人工智能为基层医院赋能,能够将顶级医疗机构的临床诊疗能力、科研能力迅速下沉到基层,推动基层医疗机构诊疗能力提升。依托高质量的医疗大数据基础,肺癌多学科智能诊断系统不仅能够实现结节筛查等初级功能,更能够实现肺癌全类型病灶的诊断覆盖,综合多学科临床信息进行综合诊断,其决策依据来源于国际、国内最新临床肺癌诊疗指南,且随着临床诊疗例数的增加,将越来越聪明,成为基层医师提升肺癌诊疗水平,降低误诊漏诊的好帮手。第一阶段成果已经在国内几十家顶级医院投入临床试用,由华西医院牵头的多中心临床实验也即将启动。

毛毛熊

护理学SCI论文高速增长,竟然有这么多临床科研策略

原以为护理学方面的SCI论文不会太多,大数据分析结果出乎意料:1,护理方面的SCI论文高速增长,中国尤快;2,护理学有独有的临床科研和SCI论文发表策略;3,发表护理论文最多的杂志,谁也猜不到。我们通过大数据分析,筛选出护理学最多的发表期刊、研究热点、最活跃的研究者;以及最关键的:极具借鉴价值的临床科研策略。1,护理学论文概况护理学领域已经发表了231,478篇Medline收录文献。2011年,仅有7,776篇论文;到2020年目前,就已经达到32,223篇论文。十年翻4.1倍。(护理学科研究论文的增长趋势)我们对其中最新发表的10,995篇论文进行大数据分析。根据护理学领域2020年发文总量,下面针护理学的数据大都是今年最近半年论文分析结果。国家分布可以看到,美国发表论文数最多,为3,648篇;中国发表的研究论文数量为1,684篇,占16.8%,排在第二位。澳大利亚、伊朗和西班牙分列第三到五位。(SCI论文的时间和国家分布)研究发表在哪些杂志?发表护理学相关研究最多的五个杂志是Int J Environ Res Public Health, PLoS One, J Adv Nurs, BMJ Open, JBI Evid Synth等。令人惊讶的是,第一个期刊竟然和康复科发表论文最多的期刊一样,都是Int J Environ Res Public Health。检索显示,这是MDPI旗下的期刊,2019年影响因子是2.849。秉持MDPI的风格:高版面费、但是审稿快(平均15.3天发回一审结果)和发表快(从接受到发表只需2.9天)。与护理学相关的收稿领域是公共卫生、环境工程、健康经济学和卫生研究、慢病和促进健康(有专题,发表了2637篇论文)、运动与健康(有专题,发表了243篇论文)。您在选刊投稿时可以从中选择期刊名中Nursing的期刊或者综合期刊。杂志后面附有影响因子,参考这个排名及影响因子,对于投稿有非常强的参考价值。需要注意的是,IF=-1的标记意味着该期刊尽管被Medline数据库收录,但不是SCI收录期刊;尤其是其中的很多是掠夺性期刊,所以投稿时要特别小心。(发表论文的杂志分布)研究热点基因和相关疾病护理学研究的主要基因包括APP, SET, PREP, IV, BDNF等;护理、糖尿病、精神卫生、抑郁和应激等是与护理学研究最关注的五种关键词。护理学研究最活跃的机构如下图所示,华西医院是发表护理学论文最多的医院。最活跃的学者护理学领域最活跃的学者及其关系网如下图所示。很多同仁在找研究生导师、或者找访问学者导师,学术上活跃的学者总是最优先的选择。包括:耶鲁大学全球卫生研究所的Omer, Saad B;美国宾州Drexel大学护理和卫生专业学院的Clegg, Deborah J;美国Emory大学Nell Hodgson Wooddruff护理学院的McCauley, Linda;美国Emory大学Nell Hodgson Wooddruff护理学院的Ramos, Kenneth;美国密歇根大学护理学院的McCabe, Sean Esteban等。2,领域内的重要论文从下图可以看出护理学领域经典论文的分布。在发表的高质量论文中,集中发表在Lancet及其子刊等医学顶刊,主要是临床指南和重要的综述。3,中国发表的SCI论文单独查中国护理学发表的论文时发现,中国已经发表了13,647篇Medline收录的论文,并且发文数量从2011年的198篇增长到2020年的3,741篇中国疼痛论文10年增长了18.9倍,显示了中国护理学临床科研的快速进步。4,对临床科研的启发大数据分析除了科研找到护理学研究发表的期刊之外,还可以找到临床科研做得最好的临床科研学者/医生,他们论文中展示的思路对于我们做临床科研有非常大的启发。尤其是对于护理学的研究,我们可以看到,几位学者,在短短的半年时间里发表了十几篇SCI论文,强烈提示发表护理学论文的套路。所以,我们分享两位学者的研究思路。1,新加坡Alice Lee Centre for Nursing Studies, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore的Wang, Wenru。在半年时间内,Wang W等发表了10篇论文。并且都是不错的临床论文,所以分享给大家。(2020) "Jolly fat" or "sad fat": a systematic review and meta-analysis of the association between obesity and depression among community-dwelling older alts Aging & mental health(2020) Traditional Chinese Medicine as a complementary therapy in combat with COVID-19-A review of evidence-based research and clinical practice Journal of advanced nursing(2020) Effectiveness of lay-led, group-based self-management interventions to improve glycated hemoglobin (HbA1c), self-efficacy, and emergency visit rates among alts with type 2 diabetes: A systematic review and meta-analysis International journal of nursing studies(2020) Supporting the mobilization of health assets among older community dwellers residing in senior-only households in Singapore: a qualitative study BMC geriatrics(2020) Mediating effect of coping style between empathy and burnout among Chinese nurses working in medical and surgical wards Nursing open(2020) The multiple mediating effects of health literacy and self-care confidence between depression and self-care behaviors in patients with heart failure Heart & lung : the journal of critical care(2020) A systematic review of self-neglect and its risk factors among community-dwelling older alts Aging & mental health(2020) The caring experience and supportive care needs of male partners for women with gynaecologic cancer: A qualitative literature review Journal of clinical nursing(2020) The development and testing of a nurse-led smartphone-based self-management programme for diabetes patients with poor glycaemic control Journal of advanced nursing(2020) Effectiveness of Tai Chi on quality of life, depressive symptoms and physical function among community-dwelling older alts with chronic disease: A systematic review and meta-analysis International journal of nursing studies总结这些研究,既有肥胖与抑郁之间关联的meta分析,也有中药和太极等对疾病的辅助治疗,以及慢病(如糖尿病、癌症、心脏病)等慢病护理和管理,更有针对护士职业倦怠的研究。对于护理学,各类慢病护理、心理干预等是很值得借鉴的临床研究思路。2,同属新加坡Alice Lee Centre for Nursing Studies, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore的Shefaly Shorey。在半年左右发表了12篇SCI论文。(2020) Traumatic Childbirth Experiences of New Parents: A Meta-Synthesis Trauma, violence & abuse(2020) The Experiences and Support Needs of Women With Gestational Breast Cancer in Singapore: A Descriptive Qualitative Study Cancer nursing(2020) Alts living with irritable bowel syndrome (IBS): A qualitative systematic review Journal of psychosomatic research(2020) The use of virtual reality simulation among nursing students and registered nurses: A systematic review Nurse ecation today(2020) A Social-Ecological Model of Grandparenting Experiences: A Systematic Review The Gerontologist(2020) Experiences and Needs of Parents Caring for Children with Cerebral Palsy: A Systematic Review Journal of developmental and behavioral pediatrics : JDBP(2020) Experiences of new nurses dealing with death in a paediatric setting: A descriptive qualitative study Journal of advanced nursing(2020) Effectiveness of healthy eating interventions among children: A quantitative systematic review Journal of advanced nursing(2021) The experiences and needs of Asian older alts who are socially isolated and lonely: A qualitative systematic review Archives of gerontology and geriatrics(2020) Communication skills training using virtual reality: A descriptive qualitative study Nurse ecation today(2020) Lessons from past epidemics and pandemics and a way forward for pregnant women, midwives and nurses ring COVID-19 and beyond: A meta-synthesis Midwifery(2020) Patients' and healthcare professionals' perspectives towards technology-assisted diabetes self-management ecation. A qualitative systematic review PloS oneShorey的研究思路更是极为清晰,主要集中在母婴领域,如初产妇的分娩、脑瘫儿童父母的护理需求,以及护士应对临床实践的研究(如患儿病死),另外也有虚拟现实在护理培训中的作用等。在高质量研究中,我们看到比较多的虚拟现实提供护理培训、远程心理干预、及精神障碍的虚拟护理研究等应用新科技改善传统护理方式的研究;对于这些新的领域、尤其是交叉学科,也是科技部对临床科研的支持重点。祝朋友们,都找到新的思路,发表更多更好的SCI论文。声明:本文转自“Hanson临床科研”,文章转载只为学术传播,无商业用途,版权归原作者所有,如涉及侵权问题,请联系我们,我们将及时修改或删除。沃斯(WOSCI)由耶鲁大学博士团队匠心打造,专注最新科学动态并提供各类科研学术指导,包括:前沿科学新闻、出版信息、期刊解析、论文写作技巧、学术讲座、论文润色等。

外丹

临床医学八年制和五年制有何区别?想学医的同学值得一看

传统的临床医学培养模式:本科5年,硕士3年,博士3年,共需11年。临床医学八年制则是本硕博贯通培养,八年拿到博士学位。首先来分析一下八年制的主要学习过程:八年制培养模式主要分为四个阶段:通识教育、基础医学、临床课程及通科实习、专科实习及毕业。1、通识教育就是所有东西都要学,微积分、线代、大物、四大化学、数据库、C++、马列主义毛泽东思想、自然辩证法…五花八门,也不知道学了有没有用,反正就是让你具有宽厚的人文社会科学和自然科学知识基础。这些课程花了我们两年的时光,很长很长。2、基础医学就是要学习解剖、组胚、生理、病生、病理、药理…这个阶段你会对人体有一个初步了解,它是什么,长什么样,由什么组成,怎么生病,怎么治疗。八年制按照系统来上课,纵向式的学习而不是传统意义上的横向学习。五年制的学习过程1、五年制是按照课本来学,比如说解剖、组胚、生理、病生、病理等等,一本书就是一门课,学完一本在说另外一本。八年制则是按照系统上课,所有课本同步上,比如说学习心血管系统,先学习解剖的心血管章节,然后是组胚的心血管章节、生理的心血管章节,以此类推,考试则是考所有书籍关于心血管系统的章节。2、最后两个阶段就进入了临床,见习实习、内外妇儿、临床科研、执医考试、毕业工作。学习的主要阵地从教室转移到医院科室,挨个科室进行学习和实习。最后选择心仪的科室和导师,跟着他在这个科室进行深造,最终通过执医考试成为一名合格的医生。八年制的利与弊其实,八年制有很多弊端,我现在比较推崇的模式是临床医学五年制+硕博连读(科研型)。八年制作为一个特殊的群体,有着自己的孤傲。因为八年制有着相对稳定的未来,按部就班,成绩大差不差,就可以挑个不错的科室最后留院。但与此同时,八年制也非常容易建立起了信息茧房。我们要在一个地方生活八年,过得相对封闭,其他人怎样我们丝毫不知,我们只知道自己看似很厉害,看似很努力。在这种温水煮青蛙的环境下,大多数的天纵英才都泯然众人!八年制毕业的时候只是一个MD,不是PhD。八年制培养的初衷就是把一帮优秀的人召集起来,花更少时间培养出一个专门搞临床的医生出来。它想培养你的临床能力,但市场大趋势要的是超强的科研能力,所以矛盾就出来了。哪怕学校想尽一切办法培养你的科研能力,时间哪来呢?根基没有变,所有的科研培养全部都是流于形式。所以,大部分八年制毕业的学生越来越不受待见。为什么我推荐临床医学五年制+硕博连读(科研型)?因为在现在这样的环境下,科研能力很重要很重要。本科五年好好学习,不要倦怠,通过考研或保研到更高的平台上去。然后以科研为主,硕博连读五年时间做出些不小的成就,为你之后的医生之路打下坚实基础。然后再参加规培专培等临床培训,虽然前期花的时间长,但是你的后期发展会非常顺畅。所有老师教授都是这样给学生说的:你们还年轻,先搞几年科研,之后再搞临床,不用急。如果你没有什么大想法,但硕士还有博士肯定也是要读的,那你就老老实实选择专业型的硕士或博士,只搞临床不搞科研,当个医生就好。只是你的竞争力会稍弱,后期职场发展会有些慢。有一个教授说过:临床都是别人的,科研才是自己的,文章更是自己的。不想给别人做嫁衣你就先好好搞研究。如果你想有所作为,那么你面前的那条路肯定非常艰苦。如果你很佛系,读个八年制或者专业型的硕士和博士也挺好,老老实实当个普通的医生。如果你心中装着天下,有着远大抱负,选了八年制就很脑阔疼,你会觉得你的专业限制了你的发展。

去丧

法匹拉韦完成临床研究 科技部建议尽快纳入诊疗方案

来源:新京报网原标题:法匹拉韦完成临床研究 科技部建议尽快纳入诊疗方案国务院联防联控机制发布会介绍我国新冠药物等研发进展,重组新冠疫苗获批启动临床试验。新京报讯(记者 许雯)新冠药物、疫苗研发备受关注和期待。昨日国务院联防联控机制就此举行新闻发布会,介绍最新研发进展并回答记者提问。记者注意到,这是疫情发生以来,国务院联防联控机制第三次召开新冠药物、疫苗研发主题发布会。3月17日,国务院联防联控机制召开发布会,介绍药物疫苗和检测试剂研发攻关最新情况。摄影/新京报记者 吴宁中国工程院院士王军志介绍,我国正按照5种技术路线进行新冠疫苗的紧急研制,分别为灭活疫苗、基因工程重组亚单位疫苗、腺病毒载体疫苗、减毒流感病毒载体疫苗和核酸疫苗。截至目前,5大技术方向疫苗总体进展顺利,第一批确定的9项任务都已完成临床前研究(即动物有效性、安全性研究)大部分工作,大部分研发团队4月份都能完成临床前研究,并逐步启动临床试验,“应该说,我国新冠疫苗研发进展目前总体上处于国际先进行列,不会慢于国外。”治疗药物方面,科技部生物中心主任张新民介绍,磷酸氯喹、法匹拉韦、中医药、恢复期血浆、托珠单抗、干细胞和人工肝的临床应用,目前均已取得良好进展。其中,法匹拉韦已完成临床研究,显示出良好临床疗效,未发现明显不良反应。张新民说,鉴于法匹拉韦安全性好、疗效明确、药品可及,经过科研攻关组组织专家充分论证,已正式向医疗救治组推荐,建议尽快纳入诊疗方案。据央视新闻报道,由中国工程院院士、军事科学院军事医学研究院研究员陈薇领衔的科研团队自抵达武汉以来,就集中力量展开在疫苗研制方面的应急科研攻关,3月16日20时18分,陈薇院士团队研制的重组新冠疫苗通过了临床研究注册审评,获批启动展开临床试验。自1月26日抵达武汉以来,陈薇院士团队联合地方优势企业,开展重组新型冠状病毒疫苗的药学、药效学、药理毒理等研究,快速完成了新冠疫苗设计、重组毒种构建和GMP条件下生产制备,以及第三方疫苗安全性、有效性评价和质量复核。陈薇介绍,按照国际的规范、国内的法规,疫苗已经做了安全、有效、质量可控、可大规模生产的前期准备工作。新京报记者 许雯