疾病研究数据库

你好，我最近也在使用ADNI数据库，我看到了可以生成EXCEL下载病人信息，但是不太专清楚下载下来的各种图像格式具属体有什么区别，有原始图像，预处理的，处理后的各种类型，并且预处理的图像也有四种格式，您是选用什么格式呢本回答被网友采纳

1,测序与序列比(Sequence Alignment) 测序物信息基础主要数据源类数据其数据序列比基本问题比较两或两符号序列相似性或相似性.物初衷看,问题包含几意义:相互重叠序列片断重构DNA完整序列.各种试验条件探测数据(probe data)决定物理基图存贮,遍历比较数据库DNA序列比较两或序列相似性数据库搜索相关序列序列寻找核苷酸(nucleotides)连续产模式找蛋白质DNA序列信息序列比考虑DNA序列物特性,序列局部发插入,删除(前两种简称indel)替代,序列目标函数获序列间突变集距离加权或相似性,齐包括全局齐,局部齐,代沟惩罚等.两序列比采用态规划算,种算序列度较适用,于海量基序列(DNA序列高达109bp),太适用,甚至采用算复杂性线性难奏效.,启发式引入势必,著名BALSTFASTA算及相应改进均前提发.2, 蛋白质结构比预测基本问题比较两或两蛋白质空间结构相似性或相似性.蛋白质结构与功能密切相关,般认,具相似功能蛋白质结构般相似.蛋白质由氨基酸组链,度501000~3000AA(Amino Acids),蛋白质具种功能,酶,物质存贮运输,信号传递,抗体等等.氨基酸序列内决定蛋白质3维结构.般认,蛋白质四级同结构.研究蛋白质结构预测理由:医药理解物功能,寻找dockingdrugs目标,农业获更农作物基工程,工业利用酶合.直接蛋白质结构进行比原由于蛋白质3维结构比其级结构进化更稳定保留,同包含较AA序列更信息.蛋白质3维结构研究前提假设内氨基酸序列与3维结构应(定全真),物理用能量解释.观察总结已知结构蛋白质结构规律发预测未知蛋白质结构.同源建模(homology modeling)指认(Threading)属于范畴.同源建模用于寻找具高度相似性蛋白质结构(超30%氨基酸相同),者则用于比较进化族同蛋白质结构.,蛋白结构预测研究现状远远能满足实际需要. 3, 基识别,非编码区析研究.基识别基本问题给定基组序列,确识别基范围基组序列精确位置.非编码区由内含组(introns),般形蛋白质丢弃,实验,除非编码区,能完基复制.显,DNA序列作种遗传语言,既包含编码区,隐含非编码序列.析非编码区DNA序列目前没般性指导.类基组,并非所序列均编码,即某种蛋白质模板,已完编码部仅占类基总序列3~5%,显,手工搜索基序列难想象.侦测密码区包括测量密码区密码(codon)频率,阶二阶马尔夫链,ORF(Open Reading Frames),启(promoter)识别,HMM(Hidden Markov Model)GENSCAN,Splice Alignment等等.4, 进化比较基组进化利用同物种同基序列异同研究物进化,构建进化树.既用DNA序列用其编码氨基酸序列做,甚至于通相关蛋白质结构比研究进化,其前提假定相似种族基具相似性.通比较基组层面发现哪些同种族共同,哪些同.早期研究采用外素,,肤色,肢体数量等等作进化依据.近较模式物基组测序任务完,整基组角度研究进化.匹配同种族基,般须处理三种情况:Orthologous: 同种族,相同功能基；Paralogous: 相同种族,同功能基；Xenologs: 机体间采用其式传递基,病毒注入基.领域采用构造进化树,通基于特征(即DNA序列或蛋白质氨基酸碱基特定位置)基于距离(齐数)些传统聚类(UPGMA)实现.5, 序列重叠群(Contigs)装配根据现行测序技术,每反应能测500 或更些碱基序列,类基测量采用短枪(shortgun),要求量较短序列全体构重叠群(Contigs).逐步拼接起形序列更重叠群,直至完整序列程称重叠群装配.算层看,序列重叠群NP-完全问题. 6, 遗传密码起源通遗传密码研究认,密码与氨基酸间关系物进化历史偶事件造,并固定现代物共同祖先,直延续至今.同于种"冻结"理论,曾别提选择优化,化历史等三种说解释遗传密码.随着各种物基组测序任务完,研究遗传密码起源检验述理论真伪提供新素材.7, 基于结构药物设计类基工程目要解体内约10万种蛋白质结构,功能,相互作用及与各种类疾病间关系,寻求各种治疗预防,包括药物治疗.基于物结构及结构药物设计物信息极重要研究领域.抑制某些酶或蛋白质性,已知其蛋白质3级结构基础,利用齐算,计算机设计抑制剂,作候选药物.领域目发现新基药物,着巨经济效益.8.物系统建模仿真随着规模实验技术发展数据累积全局系统水平研究析物系统揭示其发展规律已经基组代另外研究 热点-系统物目前看其研究内容包括物系统模拟（Curr Opin Rheumatol2007463-70）系统稳定性析（Nonlinear Dynamics Psychol Life Sci2007413-33）系统鲁棒性析（Ernst Schering Res Found Workshop 200769-88）等面SBML（Bioinformatics20071297-8）代表建模语言迅速发展布尔网络 （PLoS Comput Biol2007e163）、微程（Mol Biol Cell20043841-62）、随机程（Neural Comput20073262-92）、离散态事件系统等（Bioinformatics2007336-43）系统析已经应 用模型建立借鉴电路其物理系统建模研究试图信息流、熵能量流等宏观析思想解决系统复杂性问题（Anal Quant Cytol Histol2007296-308）建立物系统理论模型需要间努力现实验观测数据虽海量增加物系统模型辨 识所需要数据远远超目前数据产能力例于间序列芯片数据采点数量足使用传统间序列建模巨实验代价目前系 统建模主要困难系统描述建模需要创性发展9.物信息技术研究物信息仅仅物知识简单整理、数、物理、信息科等科知识简单应用海量数据复杂背景导致机器习、统 计数据析系统描述等需要物信息所面临背景迅速发展巨计算量、复杂噪声模式、海量变数据给传统统计析带巨困难 需要像非参数统计（BMC Bioinformatics2007339）、聚类析（Qual Life Res20071655-63）等更加灵数据析技术高维数据析需要偏二乘（partial least squaresPLS）等特征空间压缩技术计算机算发需要充考虑算间空间复杂度使用并行计算、网格计算等技术拓展算 实现性10, 物图像没血缘关系像呢外貌像点组像点愈重合两愈像两没血缘关系像点重合物基础基相似我知道希望专家解答11, 其基表达谱析,代谢网络析;基芯片设计蛋白质组数据析等,逐渐物信息新兴重要研究领域;科面,由物信息衍科包括结构基组,功能基组,比较基组,蛋白质,药物基组,药基组,肿瘤基组,流行病环境基组,系统物重要研究.现发展难看,基工程已经进入基组代.我应与物信息密切相关机器习,数能存误导清楚认识.

一．检索途径和方法 CBMdisc数据库中使用的布尔逻辑运算符一般有“3361323031AND”、“OR”、“AND NOT”， 通配符：“?”，可替代任何一中文字符，例如：张？、张伟？。 范围运算符：仅用于出版年字段的检索，对检索结果进行时间限定。 ＝（等于） 例PY = 2001 检索2001年发表的文献； ＞（大于） 例PY > 1998 检索1998年以后发表的文献； ＜（小于） 例PY < 1997 检索1997年以前发表的文献； ＞＝（大于等于） 例PY >= 1992 检索1992年以来（包括1992年）发表的文献； ＜＝（小于等于） 例PY <= 1990 检索1990年以前（包括1990年）发表的文献。 CBMDisc提供了5种检索途径，即基本检索、主题词检索、索引词检索、分类检索和期刊检索。 1．基本检索 可直接在检索框内输入有效检索词进行单字、文本词的检索，只要文献记录中出现与 检索词相同的实义词，系统一律检出。 ⑴ 在基本检索状态下，可进行以下一些辅助检索： ① 缺省字段：系统默认字段，表示在中文题目、文摘、作者、主题词、特征词、关键词、期刊字段查找用户输入的检索词。 ②全部字段：表示在所有可检索的字符型字段中查找用户输入的检索词。这种检索方式可使检索结果较全。 ③特定字段：指仅在某一指定字段内检索用户输入的检索词，如中文标题、英文标题、作者、地址、期刊等。特定字段检索需在检索词前后加字段标识符，“标识符”表示精确检索，“in 标识符”，表示对所选字段的任意片段进行查找。 例：“au ＝李平”，为精确检索，检出的结果均为作者“李平”发表的文章; “李平 in au”，为非精确检索，在作者字段中有“李平”或“李平贵”的文献均被检出； ④引文字段：通过“参考文献”字段可了解某种文献被引用情况。 例：查找“吴孟超”发表论文或著作被引用的情况，方法是：在“缺省“下拉菜单中选择“参考文献”字段，输入“吴孟超”，点击“检索”即可显示作者文献的被引用结果。再点击“显示”按钮进入引文题录界面。 ⑵ 各按钮作用及使用方法 ①“显示”按钮 显示光标指向的检索式的检索结果。 ②“删除”按钮 删除无用的检索式。 ③“选中”按钮 用鼠标单检索式，然后点击“选中”按钮，该检索式呈浅蓝色。然后选择“AND”、“OR ”、“NOT”按钮进行逻辑运算。如果想取消选中状态，再点击“清除”按钮，此时，检索式浅蓝色标记消失。 例：肝炎治疗 首先在检索框内分别输入肝炎和治疗，在检索结果式列表中，点击肝炎检索表达式，然后点击“选中”按钮，接着点击治疗检索表达式，再点击“选中”按钮，被点击后的两个检索表达式均呈浅蓝色，最后点击“AND”按钮将二者组配，即可得到肝炎治疗的文献。 ④“二次检索”按钮 可在第一次检索结果的基础上进行二次检索，或重新检索。检索方法与一次检索相同。在二次检索屏幕，系统显示一次检索所使用的数据库、字段、检索式，以及一次检索的命中篇数。可在一次检索的基础上进行限制检索，可浏览检出文献题目。 提示注意：“加入列表”和“检索列表”一般用于检索结果中的任何字段内容（如标题、文摘、关键词等）。使用方法：即在检索结果显示文献中，用鼠标选中被检索词（呈浅绿色），然后点击“加入列表”按钮，接着点击“检索列表”，此时被检索词自动添加到检索列表式中，进行限定检索。 ⑶ 关键词检索适用范围： ①不太熟悉规范的主题词时，可先输入关键词，再在显示记录的主题词字段中找到相应的主题词，进行更系统，更全面的检索。 ②没有相应的主题词，包括：A. 新出现的科技术语，新发现的物质及疾病名称： B. 某些特写概念，如体重、海拔、高度、剂量等：C. 中医药名称； ③在使用主题词不能检出满意的文献时，采用自由词，可能会扩大检索结果，并可根据记录中显示的主题词，比较使用的主题词是否合适或重新确定主题词。 2．主题词检索 CBMDisc主题词表收录了美国国立医学图书馆《医学主题词表》（即MESH）和中国中医研究院出版的《中医药学主题词表》的所有词条。医学主题词表是对生物医学文献进行主题分析、标引和检索时使用的权威性词表，它的作用是使医学文献的主题标引达到统一和一致，并指导用户高质量地检索医学文献。

这里有一个软件：miRTarBae，不错！它整合实验证实的miRNA靶标的数据库。输入感兴趣的miRNA，即可内找到验证了的靶基因。容靶基因在Wikipedia就可找到它的功能！目前自己的实验验证了10个miRNA,找到一个有意思的miR483,它在小鼠上靶基因是SOCS3（Suppressor of cytokine signaling 3）

去百度文库，查看完整内容>内容来自用户:乐观的圆子国际医学文献数据库检索网站｜Medline｜世界上最著名的e68a8462616964757a686964616f31333433646430医学文献检索系统之一｜AIDS  Databases｜有关艾滋病的临床实验、药物研制以及相关文献数据库｜CANCERLIT  ｜癌症数据库(National Cancer Institute)｜CHID online｜综合卫生信息数据库，提供有关卫生、卫生教育资源的题录、文摘等信息｜ClinicalTrials.gov｜向医患人员提供的临床实验信息数据库｜DIRLINE｜收集美国约17,000个政府机构、研究机构、公司、学术机构等信息｜药物信息库｜包含有9,000余种美国处方与非处方药物信息｜HSTAT｜包括有健康指南、评价、和消费者指南信息的全文数据库｜NCCAM Resources｜补充和替代医学资源｜Dietary Supplements｜提供维生素、矿物质、植物等信息｜畸形、智力迟缓数据库｜提供先天畸形、智力发育迟缓信息｜LOCATORplus｜杂志、书籍和视听教材目录数据库｜Chemical Abstract｜覆盖化学、化工、医学、生物学、环境、食品等多学科的科技文献系统｜Dialog 联机检索系统｜世界上最大的文献检索系统｜Biomedicine｜荷兰医学文摘，世界权威性的医药文献数据库。｜RHO｜生殖健康展望，由William H .Gates 基金会的基金资助｜Out Look｜有关生殖健康的论题，由 PATH 出版，联合国人口基金资助，可免费索取｜医药信息网｜有药品数据库、疾病数据库、新药数据库、医药市场等主要数据库｜MEDLINE  Search｜最权威的生

一、 引言数据库对于企业信息化3363366230的重要性是不言而喻的。数据库存储着现代企业最重要的数据，包括生产、经营、管理等各类数据，这些数据作为企业的核心信息，通过各类信息系统，为用户提供及时准确的信息，帮助用户分析，为用户提供决策依据。为提高企业的工作效率，提升企业形象，具有传统模式无法比拟的优势。其中构建合理高效的数据库，是数据库建设关键之一。如何构建合理高效的数据库是企业信息化过程要解决的问题。下面就数据库的构建谈谈自己的一些经验，希望能对大家有所帮助。 二、 设计数据库之前数据库并不是凭空想象出来的，而是根据业务部门的需要设计符合业务需求的数据库。因此在形成数据库之前需要充分了解业务需求。 1. 充分理解业务需求。需求分析是整个设计过程的基础，是最困难、最耗费时间的一步。在这期间通过与业务部门交流，了解用户的想法以及工作流程，通过双方多次交流，会形成初步的数据模型，当然这时的数据模型不会是最终的模型，还需要和用户进行交流，并且在以后的信息系统开发过程中还会反复修改。 2. 重视输入输出。在定义数据库表和字段需求（输入）时，首先应了解数据产生源和数据流程，也就是必需要知道每个数据在那儿产生，数据在那儿表现，以什么样的形式表现等等，然后根据用户提供的报表或者设计出的报表、查询和视图（输出）以决定为了支持这些输出哪些是必要的表和字段。 3. 创建数据字典和ER 图表。ER 图表和数据字典可以让任何了解数据库的人都明确如何从数据库中获得数据。ER图对表明表之间关系很有用，而数据字典则说明了每个字段的用途以及任何可能存在的别名。对SQL 表达式的文档化来说这是完全必要的。 需要注意的是，在需求分析调研过程中，并不是一帆风顺的，因为业务人员对于业务的理解不同，以及对于信息知识的缺乏，会影响需求分析的质量，为了提高质量，各方要用的时间交流与相互理解，业务部门需要精通业务的人员自始至终全力配合，而开发人员则尽量使用用户理解的业务术语交流，这样会避免出现理解不同而产生的歧义。 三、 设计合理的表结构通常合理的表结构会减少数据冗余，提高数据库的性能。设计合理的表结构要遵循以下两点。 1. 标准化和规范化 数据的标准化有助于消除数据库中的数据冗余。标准化有好几种形式，但3NF(第三范式)通常被认为在性能、扩展性和数据完整性方面达到了最好平衡。简单来说，遵守3NF标准的数据库的表设计原则是：某个表只包括其本身基本的属性，当不是它们本身所具有的属性时需进行分解。表之间的关系通过外键相连接。它具有以下特点：有一组表专门存放通过键连接起来的关联数据。 例如：某个存放单井信息及其有关油井生产日报信息的3NF数据库就有两个表：单井基础信息和油井日报信息。日报信息不包含单井的任何信息，但表内会存放一个键值，该键指向单井基础信息里包含该油井信息的那一行。 不过也有例外，有时为了效率的缘故，对表不进行标准化也是必要的。 2. 考虑各种变化 在设计数据库的时候考虑到哪些数据字段将来可能会发生变更。使数据库更具扩展性，从而减少将来数据变更所带来的损失。 例如，日期类型字段，有时我们会考虑使用字符类型代替日期类型，因为在处理日期字段上容易产生数据错误，所以我们就使用字符类型。这样的例子还很多，在做前期设计时都要考虑的。 表结构的设计不是一次就能成功的，在信息系统开发过程中会存在数据读取、录入或统计困难，为了解决这些问题会修改表结构，或增加一些字段，或修改一些字段的属性。这个过程不断重复，因此不要想一次能成功。建议使用专门设计工具来做这些工作，笔者经常使用：SYBASE PowerDesigner ，当然还有其它的工具：ORACLE Designer 2000 ，ROSE等工具。这样会使你的工作事半功倍。 四、 选择合理的索引索引是从数据库中获取数据的最高效方式之一。95%的数据库性能问题都可以采用索引技术得到解决。 1. 逻辑主键使用唯一的成组索引，对系统键（作为存储过程）采用唯一的非成组索引，对任何外键列采用非成组索引。考虑数据库的空间有多大，表如何进行访问，还有这些访问是否主要用作读写。 2. 大多数数据库都索引自动创建的主键字段，但是可别忘了索引外键，它们也是经常使用的键，比如运行查询显示主表和所有关联表的某条记录就用得上。 3. 不要索引大型字段（有很多字符），这样作会让索引占用太多的存储空间。如MEMO(备注)、TEXT(文本)等字段。 4. 不要索引常用的小型表 不要为小型数据表设置任何键，假如它们经常有插入和删除操作就更别这样作了。对这些插入和删除操作的索引维护可能比扫描表空间消耗的时间。如代码表，或系统参数表。 五、 保证数据完整性数据的完整性非常重要，这关系到数据的准确性，不准确的数据是毫无价值的，因此保证数据的完整性非常重要。 1. 完整性实现机制：实体完整性：主键参照完整性： 父表中删除数据：级联删除；受限删除；置空值父表中插入数据：受限插入；递归插入 父表中更新数据：级联更新；受限更新；置空值 DBMS对参照完整性可以有两种方法实现：外键实现机制（约束规则）和触发器实现机制用户定义完整性：NOT NULL；CHECK；触发器 以上完整性机制需要熟悉和掌握，它对于数据的完整性非常重要。 2. 用约束而非业务规则强制数据完整性 采用数据库系统实现数据的完整性。这不但包括通过标准化实现的完整性而且还包括数据的功能性。在写数据的时候还可以增加触发器来保证数据的正确性。不要依赖于业务层保证数据完整性；它不能保证表之间（外键）的完整性所以不能强加于其他完整性规则之上。 3. 强制指示完整性 在有害数据进入数据库之前将其剔除。激活数据库系统的指示完整性特性。这样可以保持数据的清洁而能迫使开发人员投入的时间处理错误条件。 4. 使用查找控制数据完整性 控制数据完整性的最佳方式就是限制用户的录入。只要有可能都应该提供给用户一个清晰的价值列表供其选择。这样将减少键入代码的错误和误解同时提供数据的一致性。某些公共数据特别适合查找：性别代码、单位代码等。 5. 采用视图 视图是一个虚拟表，其内容由SQL语句定义，视图不仅可以简化用户对数据的理解，也可以简化他们的操作。那些被经常使用的查询可以被定义为视图，从而使得用户不必为以后的操作每次指定全部的条件。另外通过视图用户只能查询和修改他们所能见到的数据。数据库中的其它数据则既看不见也取不到。数据库授权命令可以使每个用户对数据库的检索限制到特定的数据库对象上，增强数据的安全性。 六、 结束语数据库的高效运行不仅需要技术上的支持，也需要硬件平台和网络的支持以及数据库管理员的有效管理，本文只是从技术的角度说明如何提高数据库的效率，但在实际应用过程中其它方面的支持也是不可缺少的，尤其是数据库管理，数据库建设是“三分技术，七分管理，十二分基础数据”，因此对于数据库管理一定要重视，在管理到位的情况下技术才能发挥应有的作用。

循证来医学是从二十世纪九十年带来自在临床医学领域内迅速发展起来的一门新兴学科，是一门遵循科学证据的医学，其核心思想是“任何医疗卫生方案、决策的确定都应遵循客观的临床科学研究产生的最佳证据”，从而制订出科学的预防对策和措施，达到预防疾病、促进健康和提高生命质量的目的。国内数据库就是北京康健还可以吧反弹今天

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是中文核心期刊,中文核心期刊投稿对文章质量要求都比较高,审稿的周期在3-6个之间,有的会更长。仅供参考~